usegalaxy.org手册
该剧本用于部署和维护公共Galaxy服务器,即和 。 本文中的一般角色已发布到 ,可以通过ansible-galaxy命令安装以供您自己使用,但此处也包含一些特定于站点的角色。
该手册不适合其他站点的Galaxy部署人员/管理员使用,但对于希望模拟usegalaxy.org这样的设置的任何人都应该作为参考。
用法
使用文档可在。 可以使用的目标来完成所有标准的剧本操作。
您将需要库密码才能运行大多数游戏。 这些可以在galaxyproject 。 如果已配置了gpg-agent(1) ,则可以避免在每次执行时都提示您输入密码。
建造笔记
注意:现在已过时,需要更新
在某些HPC系统上以非特权用户的身份建立Pulsar依赖项的依赖项是一个困难的手动过程,因此我做了一些说明,这可能会有所帮助:
slurm-drmaa手动编译并安装在Stampede上(未安装slurm-devel(或更糟糕的是,某些登录节点的版本不匹配),因此我必须解决此问题):
cd slurm
mkdir -p include/slurm
cd src/slurm-2.6.3
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