乌克布兰格尔 -:construction:正在施工:construction:- 概述 ukbwranglr的目标是利用UK Biobank表型数据促进探索性分析。 原始UK Biobank表型文件中的某些列可以通过人类可读的标签加载到R中: 原始数据外观: #> eid 31-0.0 34-0.0 21000-0.0 20002-0.0 21001-0.0 #> 1: fake1 0 1952 NA 1665 20.1115 #> 2: fake2 0 1946 4001 1383 30.1536 #> 3: fake3 1 1951 3 1197 22.8495 #> 4: fake4 0 1956 NA 1441 23.4904 #> 5: fake5
2021-11-24 20:27:20 1.52MB package r uk-biobank HTML
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R包ukbnmr UK Biobank中用于处理Nightingale NMR生物标志物数据的工具 该软件包提供了用于处理NMR代谢组学数据的实用程序。 当前有两个主要功能: extract_biomarkers()和compute_nightingale_ratios() 。 extract_biomarkers()函数将采用输出的原始数据集,提取NMR生物标志物字段,并 提供简短的列名。 度量也分为多行,参与者在基线和首次重复评估中都具有度量。 compute_nightingale_ratios()函数将从168种生物标记物中计算出,这些生物标记可从下载。 这个包还提供了data.frame的生物标记信息,加载nmr_info 。 安装 可以使用remotes软件包从GitHub安装此软件包: remotes::install_github("sritchie73/ukbn
2021-10-14 10:23:07 18KB R
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ukbtools 使用随附的[UKB程序]( )下载并解密UK Biobank(UKB)数据后,您需要将多个文件汇集在一起​​,为您提供了一个可探索的数据集。 数据文件具有列名,这些列名是中编辑的字段代码。 ukbtools可以轻松地将多个UKB文件折叠到单个数据集中以进行分析,在此过程中,将为变量赋予有意义的名称。 该软件包还包括以下功能:检索ICD诊断,在UKB样本的背景下探索样本子集以及收集遗传元数据。 安装 # Install from CRAN install.packages( " ukbtools " ) # Install latest development version devtools :: install_github( " kenhanscombe/ukbtools " , dependencies = TRUE ) 先决条件:制作UKB文件集 下载§,然
2021-10-12 15:12:38 3.49MB r biobank ukb uk-biobank
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