Tassel中文用户手册.虽然自从 2001 年开始公开发行以来 TASSEL 已经发生了相当大的变化，但是它的主要 功能仍然是为研究表现型和基因型之间的关系提供工具[1]。 TASSEL 的功能有：关联研究， 评价进化关系，分析连锁不平衡，主成分分析，聚类分析， 估算缺失数据，数据可视化。 TASSEL 的开发由玉米遗传学和基因组学的一个课题组领导，因此这个软件的设计和计算上 的优化都是为了解释很多植物和育种情况中存在的生物学现象。 与人类遗传学相比，很多作 物在核苷酸水平和结构变异上都是非常多样的（多样性比人类大 10 – 50 倍），近交和大的家 系也是常见的，并且全基因组预测正在日益应用于现实世界的问题。 这些生物学的差异导致 一些不同的优化，这些优化对作物之外的很多生物学系统也有用处。

Tassel主要是研究基因型与表现型之间的关系。有多种功能，包括：关联分析、评估进化关系、主成分分析、聚类分析、推断缺失数据、数据的可视化。

tassel 程序操作简介，以简单的例子来简述tassel这个软件的使用方法，简洁明了

用于关联分析，获得分子标记与性状之间的关系，为找到目标基因提供最基本的定位信息。

做功能基因定位的生物狗基本都知道，经过10来年的发展，关联分析与连锁分析一样，已经成为一项基本工具，广泛应用于动植物功能基因挖掘中。在动植物（尤其是植物）的关联分析中，TASSEL软件是最早出现的开源软件，相对于其他软件，TASSEL也是使用的最广泛的

很优秀的数据多态性分析软件，具有强大的分析功能和数据可视化功能