FragPipe 是一套计算工具的 Java 图形用户界面 (GUI),能够对基于质谱的蛋白质组学数据进行综合分析。 它由提供- 一种适用于常规和“开放”(宽前体质量耐受性)肽识别的超快蛋白质组学搜索引擎。 FragPipe 包括工具包,用于 MSFragger 搜索结果(PeptideProphet、iProphet、ProteinProphet)的下游后处理、FDR 过滤、基于标签的量化和多实验总结报告生成。 和以帮助解释开放搜索结果。 FragPipe 二进制文件中还包括用于基于 TMT/iTRAQ 同量异位标记量化的 、用于具有运行间匹配 (MBR) 功能的无标签量化的 、SpectraST 和 EasyPQP 谱库构建模块以及 DIA-Umpire SE 模块用于直接分析数据独立采集 (DIA) 数据。 FragPipe 教程 (涵盖所有 FragPipe 模块的通用教程)
2023-10-02 23:18:51 19.35MB search-engine gui pipeline proteomics
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排名检索引擎 这是使用(VSM)进行分级检索的索引和搜索技术的Python实现。 具体而言,为向量空间评分实现了加权方案。 对于余弦值的计算,由于不影响查询文档之间的相对余弦分数关系,因此有意将查询向量长度的归一化作为优化决策而省去了。 要求 已安装 使用数字命名的组成文档建立索引和搜索的语料库(例如,NLTK数据中的路透社语料库) 索引编制 命令: $ python index.py -i -d -p 是要建立索引的文档集合的目录 是要由索引器创建的字典的文件名 行的格式为:“” 最后一行包含元信息,并指示所有以升序索引的docID以及其矢量长度,格式为: 例如metadata:1
2023-07-03 10:57:21 7KB Python
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搜索引擎 我的学术专案
2022-05-11 19:47:54 868KB 系统开源
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新闻搜索引擎 使用方法 安装python 3.4+环境(推荐或 ) 安装lxml html解析器,命令为pip install lxml 安装jieba分词组件,命令为pip install jieba 安装Flask Web框架,命令为pip install Flask 进入web文件夹,运行main.py文件 :浏览器,访问输入关键字开始测试 如果想抓取最新新闻数据并编制索引,一键运行./code/setup.py ,再按上面的方法测试。 2020.4.5:添加抓取的爬虫程序。先运行./code/spider.chinanews.com.py爬取最近5天新闻(约2500条);然后注释./
2022-05-03 12:21:54 7.9MB search-engine flask news jieba
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Reactjs Github搜索引擎 该项目使用Github API来获取用户个人资料及其存储库。 它的设计非常简单。 搜索用户就像在搜索框中输入用户名一样简单。
2022-03-08 19:34:24 172KB react javascript reactjs github-searcher
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OpenSSE:打开草图搜索引擎 大家好! 我对在SIGGRAPH 2012上非常感兴趣,所以我开发了OpenSSE,只是为了好玩。 这是一个开源草图搜索引擎,用于基于草图图像作为输入的3D对象检索。 实际上,它可以检索更多内容,例如图像,视频,点云模型和体积模型,您只需要获取其画线图像即可。 为了清楚地显示如何工作,我使用了单线程和ascii编码进行文件存储。 张东东 由OpenSSE提供支持的演示 该演示涉及3D网格模型。 查看更多搜索结果,点击。 识别输入的草图图像,您可以通过尝试。 查看更多搜索结果,点击。 有趣的演示 注:下面的演示中没有被OpenSSE供电,但我认为它们共
2022-02-24 21:07:21 915KB search search-engine sketch sse
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flask-ponywhoosh:Flask全文搜索引擎
2022-02-11 21:08:59 3.77MB python search-engine flask whoosh
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使用python 3的简单搜索引擎 这个小型项目将使用Vector Space Model实现一个简单的搜索引擎。 数据将从越南每日新闻如被抓取 ,, 和。 工具 如果未安装,请安装和 。 使用pip安装以下软件包: (用于发出HTTP请求)。 (越南NLP工具包)。 (用于解析HTML和XML)。 $ pip install requests underthesea beautifulsoup4 (可选)安装pytest来运行单元测试: $ pip install pytest $ cd /path/to/project $ pytest 安装并将该项目克隆到本地计算机中: $ git clone https://github.com/vancanhuit/simple-search-engine.git $ cd simple-search-engine 注意:如果
2022-02-04 17:33:23 4.36MB search-engine python3 vector-space-model Python
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使用spark sql模拟带倒排索引的简单搜索引擎演示: :
2022-01-09 19:12:00 3KB Python
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网络搜索引擎 信息检索课程作业,基于空间向量模型和PageRank的搜索引擎。代码的组织以及使用,请查看实验报告。
2021-12-05 11:06:16 10.84MB Python
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