primer3-py:简单的寡核苷酸分析和引物设计
Primer3-py是流行的Primer3库的Python抽象API。 目的是为自动化寡核苷酸分析和设计提供一个简单可靠的界面。
常规寡核苷酸分析很简单:
>>> import primer3
>>> primer3.calcTm('GTAAAACGACGGCCAGT')
49.16808228911765
>>> primer3.calcHairpin('CCCCCATCCGATCAGGGGG')
ThermoResult(structure_found=True, tm=34.15, dg=337.09, dh=-36300.00,
ds=-118.13, msg=)
...并且速度快(比传统的子流程包装器快1000倍):
In [1]: import primer3
In [2]: %timeit
2021-07-16 09:47:43
525KB
C
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