吉布斯采样matlab代码（回收）No-U-Turn-Sampler：Matlab实现 该存储库包含Hoffman和Gelman（2014）的No-U-Turn-Sampler（NUTS）的Matlab实现以及Nishimura和Dunson（2016）的扩展Recycled NUTS。 脚本“ getting_started_with_NUTS_and_dual_averaging_algorithm.m”说明了主要功能“ NUTS”和“ dualAveraging”的用法。 其他示例可以在“示例”文件夹下找到。 回收的NUTS实现“ ReNUTS”位于“回收”文件夹下，该功能通过回收NUTS轨迹的中间状态，提供了改进的统计效率，并且几乎没有额外的计算时间。 这里的代码适合于研究目的，因为它提供了对NUTS内部工作的访问，并且是可自定义的。 作为一个示例，此处的实现允许人们将NUTS用作Gibbs步骤。 对于希望更好地了解NUTS和HMC如何工作（以及何时可能表现不佳）的人员，该代码也应该有用。 但是，对于应用贝叶斯建模，使用Stan将是利用NUTS和HMC通用性的最简单方法。 此外

桑普利 2018年5月29日：0.3版 Sampyl是一个使用MCMC方法从概率分布中采样的软件包。 类似于使用theano来计算梯度的PyMC3，Sampyl使用来计算梯度。 但是，您可以自由编写自己的梯度函数，而不必使用autograd。 该项目的开始是通过仅使用Python和numpy定义模型来使用MCMC采样器的方式。 Sampyl当前包括以下采样器： 大都会-哈丁斯 哈密​​顿量 坚果 片 对于每个采样器，您传入一个函数，该函数计算要从中采样的分布的对数概率。 对于汉密尔顿和NUTS采样器，还需要梯度对数概率函数。 如果安装了autograd，则将自动计算梯度。 否则，采样器将接受gradient log-p函数，无论是否安装了autograd，都可以使用它们。 它仍在积极开发中，即将推出更多功能！ 依存关系 适用于Python 2或3。 当前， 和是唯一的依赖项。 要使

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目前最全的NMR数据处理资料，文件太大了，只能通过网盘链接。