Squidpy-Python中的空间单细胞分析
Squidpy是用于分析和可视化空间分子数据的工具。 它建立在和基础之上,从中继承了模块化和可伸缩性。 它提供了可利用数据的空间坐标以及组织图像(如果可用)的分析工具。
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手稿
请参阅我们在bioRxiv上的以了解更多信息。
Squidpy的关键应用
从空间坐标构建和分析邻域图。
计算细胞类型和基因的空间统计。
利用有效地存储,分析和可视化大型组织图像。
探索和大型组织图像 。
安装
通过运行以下命令通过PyPI安装Squidpy:
pip install squidpy
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2022-03-17 15:24:40
9.5MB
Python
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