GSEApy
GSEApy：Python中的基因集富集分析。
有关使用GSEApy的示例，请单击此处：
发行说明： :
常见问题解答：
GSEApy是GSEA和包装器Enrichr Python实现。
GSEApy可用于RNA序列，ChIP序列，微阵列数据。 它可用于方便的GO富集并以python生成出版物质量数据。
GSEApy有六个可用的子命令： gsea ， prerank ， ssgsea ， replot enrichr ， biomart 。
gsea：
gsea模块产生GSEA结果。 输入以gmt格式查询txt文件（FPKM，预期计数，TPM等），cls文件和gene_sets文件。
预排名：
prerank模块产生预排名工具结果。 输入期望以.rnk格式提供的具有相关值的预排序基因列表数据集，并以gmt格式提供gene_sets文件。 prer
2021-12-09 14:24:08
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Prior Guided Feature Enrichment Network for
Few-Shot Segmentation论文翻译
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How To... Evaluate SeqCap EZ Target Enrichment Data.pdf
2021-08-04 14:04:06
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Coverage Uniformity OverOnTarget Rate for Efficient Targeted NGS
2021-08-04 14:03:52
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基因本体论工具
作者
海宝堂（ ）
DV（ ）
布伦特·佩德森（）
菲德尔·拉米雷斯（ ）
Aurelien Naldi（ ）
帕特里克·弗里克（ ）
杰夫·尤恩斯（ ）
佐藤健太（ ）
克里斯·蒙加（Chris ）
格雷格·（ ）
戴维·德托马索（ ）
奥尔加·（ ）
电子邮件
执照
BSD
描述
该软件包包含一个Python库，用于
根据Fisher的精确测试，处理某些GO术语的过高和不足表示。 具有多种多样的校正例程，包括Bonferroni，Sidak，Holm和错误发现率的本地实现例程。 此外，还包括从多个测试校正 ：FDR的Benjamini / Hochberg的，FDR的Benjamini / Yekutieli，霍尔姆-Sidak，西门斯-Hochberg指出霍梅尔，FDR 2级的Benjamini-Hochberg的，F
2021-03-01 18:08:59
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