自述文件 快速入门指南 # Extract read mapping $ ./cnvnator -root file.root -tree file.bam -chrom 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16\ 17 18 19 20 21 22 X Y OR $ ./cnvnator -root file.root -tree file.bam -chrom $(seq 1 22) X Y OR $ ./cnvnator -root file.root -tree file.bam -chrom chr1 chr2 chr3 chr4 chr5 chr6 chr7 chr8\ chr9 chr10 chr11 chr12 chr13 chr14 chr15 chr16 chr17 chr18 chr19 chr20 chr21 chr22
2024-06-05 22:47:17 71.79MB
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cnvgram 绘制 CNV 图 信息 Program: cnvgram Version: 0.0.1 Author: Colby Chiang (cc2qe@virginia.edu) Date: 11/29/2011 Affiliation: UVA, CHGR, MGH Description: cnvgram is a script written in R to conveniently draw chromosomal ideograms with copy number variants and genes. 例子 要查看示例,请导航到目录并打开 (驱动程序脚本)。 必须将源文件( 文件的第一行)指向 (源文件)的正确路径,否则将无法运行。 CNVs 驱动程序文件中的函数“importCnvs”引用了一个 16 列的文本文件,其中包含您要绘制的所有 CNV 的数据。
2023-03-11 17:22:24 129KB R
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多类图像分类器 将视网膜OCT图像分为4类之一-NORMAL,CNV,DME或DRUSEN 分析的目标和动机正如我们所知道的,人类的预期寿命空前高。 由于医疗用品,服务和技术的增加,人们的寿命比祖先长。 因此,由于与眼睛健康有关的退化作用主要随着年龄而增加,因此眼睛疾病增加。 伴随着这种情况,由于数字化,近来人类在屏幕前花费越来越多的时间,这进一步增加了眼睛黄斑变性的问题。 需要开发更有效,快速和简便的方法来检测眼部疾病。 该项目的动机是研究一种可以帮助眼科医生使用图像识别技术更准确,更快速地识别视网膜疾病的技术。 我们可以检测到最常见的眼部疾病,因为它们很常见,因此无需花费很多时间就可以检测出来。 该项目涉及的眼疾是 AMD(与年龄有关的肌肉变性):这种疾病在老年人中很常见,并且是由于视网膜受损或组织死亡引起的。 在全球75岁以上的成年人中,约有35%患有AMD。 DR(非绝热性视网
2022-01-14 20:45:38 1.28MB JupyterNotebook
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病理切片图像处理软件
2021-10-13 19:06:07 352.15MB 病理切片图像处理软件
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低深度CNV学习笔记.pdf
2021-08-16 22:10:35 146KB low pass cnv wgs
华为海思最新B200 模组手册 BC28-CNV&BC95-CNV,NB-IoT开发手册
2021-08-11 18:01:17 12.96MB BC28-CNV BC95-CNV NB-IoT 华为海思B200
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2021-孕妇外周血浆胎儿游离DNA高通量测序筛查致病性拷贝数变异的技术标准共识.pdf
2021-08-04 14:03:51 1.43MB 外周血 胎儿游离DNA cfDNA CNV
偏小二乘法检验matlab代码GeneExp_and_CNV_FCsignatures 用于再现 AHBA 基因表达空间模式与 16p11.2 缺失和 22q11.2 缺失的 FC 特征之间关联结果的脚本。 请引用:。 依赖关系 该代码是在 R2019b 中编写和测试的,还包括重现报告的分析和统计数据所需的数据。 脚本可以直接运行以重现偏最小二乘回归 (PLSR) 分析和每个基因分析的相关性。 此外,还包含一个 R 脚本以使用 和 制作直方图。 分析 调用偏最小二乘回归 (PLSR) 和每个基因相关性分析。 运行: script_call_PLSR_and_CorrPerGene.m 这将调用以下脚本: 1: code/script1_call_PLSR_nodal_and_regional.m 然后 2: code/script2_call_CorrPerGene.m PLSR 结果(解释的百分比方差 (PCTVAR) 和 p 值)以及 CorrPerGene 结果(Pearson r、p 值、FDR p 值)作为 .xlsx 文件保存在data文件夹中。 最后,可以使用 16p11
2021-06-08 18:05:24 93.51MB 系统开源
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cnvHiTSeq是一组基于Java的命令行工具,用于使用下一代测序数据检测拷贝数变体(CNV)。 cnvHiTSeq使用标准BAM文件作为输入。
2021-04-29 17:05:26 6.87MB 开源软件
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介绍了关于FX3U-CNV-BD英文使用说明书的详细说明,提供通讯接口设备的技术资料的下载。
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