OCT文件转换器
该存储库包含用于从制造商的专有文件格式中提取原始光学相干断层扫描（OCT）和眼底数据的代码。
动机
制造商使用专有数据格式存储数据通常会阻碍眼科研究。 例如，直到最近，UK Biobank项目中约200,000次OCT扫描仅以Topcon的.fds文件格式提供，这阻止了批量处理和分析。 唯一允许访问这些扫描的免费软件是 ，它是用C ++编写的，不再进行维护。 该存储库旨在提供可用的基于python的工具来读取这些专有格式。
支持的文件格式
.fds（Topcon）
.fda（Topcon）
.e2e（海德堡）
.img（Zeiss）
.dcm
安装
需要python 3.7或更高版本。
pip install oct-converter
用法
examples /中包含许多示例用法脚本。
这是读取.fds文件的示例：
from oct_converter .
2021-09-27 10:31:57
17KB
1