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乌根 下载UGENE： ://ugeneunipro.github.io/ugene/ 建筑UGENE 先决条件 确保已安装Qt（> = 5.4.2和<= 5.15）开发库： 我们强烈建议您使用Qt在线安装程序将Qt安装到任何操作系统上。 这是Windows和macOS操作系统（也适用于Linux）的主要方式。 要安装Qt，请从Qt官方网站（ ）下载在线安装程序。 确保已安装以下组件： Qt Prebuild组件 Qt脚本 安装Qt的其他选项： Ubuntu> = 14.04：`sudo apt-get install qt5-default qttools5-dev-tools qtscript5-dev libqt5svg5-dev Ubuntu 12.04： 下载并安装Qt 5.5.1： 设置系统变量：export PATH = $ PATH：〜/ Qt5.5.1 / 5.5 / gcc_64 / bin sudo apt-get install g++ libgl1-mesa-dev libglu1-mesa-dev Fedora： sudo yum ins

rnaseq_variant_calling_workflow 下载 使用以下命令克隆git存储库： git clone https://github.com/durrantmm/rnaseq_variant_calling_workflow.git 安装 此工作流使用conda环境来满足所有必要的依赖关系。 确保您已安装anaconda。 下载。 您只需输入以下内容就可以安装工作流程： bash install.sh 在您的控制台中。 现在是时候进行配置了。 配置 这是正确运行工作流程中非常重要的一步。 打开提供的config.yaml文件以开始使用 设置GATK和Picard执行路径 config.yaml文件的前两个参数是 gatk_path: "java -jar /path/to/GenomeAnalysisTK.jar" picard_path: "java -jar

NIPYPE：Python中的神经成像：管道和接口 当前的神经影像软件为用户提供了使用多种不同算法分析数据的难得的机会。 但是，这导致了专用应用程序的异构集合，而没有透明的互操作性或统一的操作界面。 Nipype是NiPy旗下由社区开发的开放源代码计划，它是一个Python项目，可为现有的神经成像软件提供统一的界面，并促进单个工作流程中这些软件包之间的交互。 Nipype提供的环境鼓励交互式探索来自不同软件包（例如SPM，FSL，FreeSurfer，AFNI，Slicer，ANTS）的算法，简化了软件包内部和软件包之间的工作流程设计，并减少了使用不同软件包所需的学习曲线。 Nipype正在使用高级语言为神经影像软件开发创建一个协作平台，并解决现有管道系统的局限性。 Nipype允许您执行以下操作： 轻松与来自不同软件包的工具进行交互 结合来自不同软件包的处理步骤 重用旧步骤中的常

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