该程序用于使用 Benoît Roux (Roux B. Comput Phys Comm. 1995;91:275–) 的工作中概述的加权直方图分析方法 (WHAM) 从伞状采样模拟中计算平均力 (PMF) 的潜力282.)。
该程序尚未经过彻底测试!!!
该计划的当前限制包括:
仅可用于 GROMACS 模拟包中的数据。
仅可用于一维 PMF。
输入数据必须是来自 GROMACS 的 pullx.xvg 格式,尚未实现 pullf.xvg 的使用。
几个重要参数是硬编码的,包括温度和直方图范围。
此程序需要以下库:
Boost 库(特别是 boost 文件系统、boost 系统和 boost program_options)
该计划存在的主要原因是:
我需要彻底了解WHAM的实现。
Grossfield 的 wham 程序需要一个复杂的元数据文件。 该文件中的大部
2021-11-18 18:35:16
7KB
C++
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