遗传数据分析软件，常用来分析SSR标记等，多用于单倍体和二倍体。

可进行各种类型生物的群体遗传结构分析，遗传结构数据处理，可以用来计算不同作物品种间的遗传一致度、遗传距离、遗传分化系数（Fst）、基因流（Nm）

群体遗传学分析软件，用于遗传多样性等分析。POPGENE is a user-friendly Microsoft® Window-based computer package for the analysis of genetic variation among and within natural populations using co-dominant and dominant markers and quantitative traits.

POPGENE 这个软件可以用来测很多遗传多样性参数，包括等位基因数（Na，Ne）、 Nei’s 遗传多样性指数（He）、 shannon’s 多样性信息指数（I）、多态位点百分率（PPB）、遗传分化 值（Gst）、基因流（Nm）、遗传距离等等，是用来检测遗传多样性最普遍的软件，使用起来 也不难，只要把数据格式弄好就可以了

POPGENE中文使用说明，把难以理解的英文操作程序转化成英文，方便快捷

判断 Nei’s (1972)遗传特性和遗传距离以及不偏遗传特性和遗传距离Dendrogram: 用 UPGMA 做基于 Nei’s 遗传距离的树形图

ssr等分子标记分析软件，等位基因统计，期望杂合度，观测杂合度统计等，