matlab sir 模型代码pMCMC-SIR 这是 Rasmussen, DA, Ratmann, O., & Koelle, K. (2011) 中使用的粒子 MCMC 代码的 R 版本。 . PLoS 计算生物学，7(8)，e1002136。 原始代码是用 MATLAB 编写的，可从 . 我将原始 MATLAB 代码翻译成 R 并保留原始代码和模拟数据的文件结构。 要使用模拟数据运行 SIR 流行病学模型的粒子 MCMC 算法，请在 R 终端中键入以下命令 source( ' main_Inference.R ' )

使用 Walker 的 MCMC 算法从 Julia 中的非归一化pmf进行采样

MCMC算法：在该过程中，在给定当前知识或信息的情况下，对于未来预测是无关的，这是马尔可夫性质，MCMC算法是世界前10算法。

mcmc算法研究的文章

matlab +人口增长代码伪边际MCMC 用于贝叶斯参数估计的伪边际MCMC算法的MATLAB示例。 我们实施（*）粒子边缘MCMC算法（Andrieu和Roberts 2009），对非线性状态空间模型的参数执行精确的贝叶斯推断。 Andrieu和Roberts显着证明（另见Beaumont 2003），当似然函数近似时，使用似然函数的无偏估计量（例如使用顺序蒙特卡洛算法使用有限数量的粒子获得的估计量）足以获得精确的参数推论。插入到标准MCMC算法中（并且不考虑粒子数量）。 这就是为什么这类算法有时被称为“精确近似”的原因。 可以在我们的幻灯片中找到我们的示例以及方法，该方法在Darren Wilkinson的两篇博客文章中也得到了很好的说明，请参见下面的参考。 请注意，推理引擎（pseudomarginal.m）并不是很通用：即先验密度是硬编码的，即代码不是独立于问题的。 （*）这主要基于Fredrik Lindsten编写的代码，可从以下网站获得 参考 马萨诸塞州，博蒙特（Beaumont），马萨诸塞州，2003年。估算受基因监测的种群的人口增长或下降。 遗传学，164（3），第

一个 GUI 演示了 MCMC 如何估计损坏信号中的正弦参数（幅度、频率、化合物数量）

MCMC算法报告：完成的是《贝叶斯统计》P295页的大作业 MCMC算法PPT： MCMC原理，上课老师的PPT 4个文件夹，每个文件夹，都实现了1种方法，独立使用，且都附有运行结果图。 第1个文件夹： 随机游动txt：主函数 mycumprod.txt：用来计算似然函数 第2个文件夹： MH算法mcmc.txt：主函数 mycumprod.txt：用来计算似然函数 mycalc_density.txt：用来计算二维正态概率密度 mycalc_S.txt：用来计算Fisher信息矩阵 第3个文件夹： MH逐分量算法.txt：主函数 mycumprod.txt：用来计算似然函数 第4个文件夹： 切片Gibbs算法.txt：主函数

著名的Markov Chain MonteCarlo算法，详细的讲解