提供实时多关联网络集成算法,用于使用 mashup 和 GeneMANIA 预测基因功能。
我们利用 Mashup 算法来替换 GeneMANIA 的线性回归部分,这被证明是非常高效的
背景
大多数成功的蛋白质功能预测计算方法集成了多个基因组学和蛋白质组学数据源,以推断未知蛋白质的功能。这些算法中最准确的算法运行时间长,因此不适合在大型基因组中进行实时蛋白质功能预测。结果,这些算法的预测存储在静态数据库中,很容易变得过时。因此,提出了 GeneMANIA,它与领先的方法一样准确,同时能够实时预测蛋白质功能。
用于基因功能分析的多网络拓扑的紧凑集成。Cho,Hyunghoon 等人。细胞系统,第 3 卷,第 6 期,540 - 548.e5