医学影像作业 基于医学影像配准+DUNet实现的视网膜血管检测_眼底血管分割源码+数据集+实验报告.zip 图像配准 眼底血管分割实验 详细操作说明 实验报告 【实验思路】 1.图像预处理: 单通道化RGB2Gray 归一化 对比度限制自适应直方图均衡化 伽马校正 2.图像分割成小块patch 3.torch写网络 Unet ![Unet.png](./show_img/Unet.png) - Unet++ ![Unet++.png](./show_img/Unet++.png) 4.训练与测试,计算每个小patch的train_loss和dice_score 5.合并图像 6.计算整体测度 【实验结果】 CHASE数据集用cuda训练batchsize为2,网络采用UNet++,轮数epoch=5,测试集结果:avarage Dice: **78.03%**, avarage Accuracy: **96.91%** DRIVE数据集用cpu训练batchsize为8,网络采用UNet,轮数epoch=5,测试集结
pytorch-3dunet PyTorch实施3D U-Net及其变体: 基于3D U-Net的标准3D U-Net ÖzgünÇiçek等人。 基于残差3D U-Net。 该代码允许对U-Net进行以下方面的训练:语义分割(二进制和多类)和回归问题(例如降噪,学习解卷积)。 二维U网 也可以训练标准2D U-Net,有关示例配置,请参见 。 只需确保将单例z维保留在H5数据集中(即(1, Y, X)而不是(Y, X) ),因为数据加载/数据扩充始终需要3级张量。 先决条件 Linux NVIDIA GPU CUDA CuDNN 在Windows上运行 该软件包尚未在Windows上进行过测试,但是有报告称该软件包已在Windows上使用。 要记住的一件事:在使用CrossEntropyLoss进行训练时:配置文件中的标签类型应该从long更改为int64 ,否则会出现错误:
2021-11-16 15:48:36 30.49MB pytorch unet semantic-segmentation volumetric-data
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PyTorch上的语义分割 该项目旨在为使用PyTorch的语义细分模型提供简洁,易用,可修改的参考实现。 安装 # semantic-segmentation-pytorch dependencies pip install ninja tqdm # follow PyTorch installation in https://pytorch.org/get-started/locally/ conda install pytorch torchvision -c pytorch # install PyTorch Segmentation git clone https://github.com/Tramac/awesome-semantic-segmentation-pytorch.git # the following will install the lib with symb
2021-10-11 16:39:42 653KB pytorch semantic-segmentation Python
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