gnina（发音为NEE-na）是一个分子对接程序，具有使用卷积神经网络对配体进行评分和优化的综合支持。 这是的叉子，是的叉子。 帮助 请。 提供一个示例Colab笔记本，其中显示了如何使用gnina。 引文 如果您发现gnina有用，请引用我们的论文： GNINA 1.0：分子对接与深度学习（主要应用引用） 阿McNutt，P Francoeur，R Aggarwal，T Masuda，R Meli，M Ragoza，J Sunseri，DR Koes。 ChemRxiv，2021年 卷积神经网络的蛋白质配体评分（主要方法引用） M Ragoza，J Hochuli，E Idrobo，J Sunseri，DR Koes。 J.化学。 Inf。 模型，2017 基于原子网格的卷积神经网络的配体姿态优化M Ragoza，L Turner和DR Koes。 分子与材料的机器学习NIP

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该书从基因、RNA、蛋白质、表观遗传学四个方面介绍计算生物学和生物信息学知识、案例。作者是Ka-Chun Wong。该电子书文字可复制。

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学习计算流体力学必备图书，讲的很细致，最常用的理论都是在这里面

精确计算球体和网格单元的重叠体积和面积 计算球体与通常使用的网格元素（例如四面体或六面体）之一的相交或重叠体积是令人惊讶的挑战。 这个仅标头的库实现了一种数字健壮的方法来确定此卷。 该代码中使用的数学表达式和算法在进行了描述。 因此，如果您在产生任何出版物的项目中使用该代码，请引用本文。 利用用于计算重叠体积的概念和例程，也可以使用此库来计算球体的相交或重叠区域以及网格元素的小平面。 用法 支持的原语 重叠计算直接支持以下元素类型： 四面体（4个节点/顶点，数据类型为Tetrahedron ） 五面体/楔形/三角棱镜（5个节点/顶点，数据类型为Wedge ） hexahedra（6个节点/顶点，数据类型为Hexahedron ） 元素必须是凸形的，并且必须指定为三维节点/顶点的列表，而球体（数据类型Sphere ）则需要一个中心点和半径。 节点排序 重叠库的元素类型遵循项目的

Computational Fourier Optics：a MATLAB tutorial 傅里叶光学，带MATLAB代码，非常实用

matlab终止以下代码计算电磁学（FDTD分析） 用于实现有限差分时域（FDTD）算法的Python 3和MATLAB代码，用于求解用于建模不同电磁结构的Maxwell方程。 Python代码具有以下依赖关系- -用于网格离散化 -用于一般地块 -用于表面图 实施模型的描述 高斯脉冲在均匀介质中的传播 高斯脉冲在吸收边界条件（ABC）终止的均匀介质中的传播 高斯脉冲通过极限边界处与ABC的界面传播 正弦波通过极限边界处与ABC的界面传播 具有开放式端接（ZL =∞）和ABC的50Ω微带传输线 两条对称间隔的50Ω微带传输线，带开放式端接（ZL =∞）和ABC 两条对称间隔的50Ω微带传输线，带开放式终端（ZL =∞），带状线之间有一个圆柱形介电区，并在一条带上供电 两端口50Ω传输线，在传输端具有高斯馈电。 在时域和频域分析接收端的相应信号 两端口50Ω传输线，发射端由正弦脉冲调制高斯信号 两端口50Ω传输线，带有Luebber的信号源（集总信号源具有内部电阻）和信号源锥形（信号源从地平面到带状线的阶梯状FDTD网状过渡），用于获得高斯信号 两端口50Ω传输线，中间有一个圆柱形介电区