GC计算 从基因组数据中计算 GC 含量和 GC 偏斜的 circos 格式数据。 用法 用法:GCcalc.py -f input.fa [-w 1000] [-s 1000] 选项:-h, --help 显示此帮助信息并退出 -f FASTA, --file=FASTA Input Fasta format file -w WINDOWSIZE, --window=WINDOWSIZE default:1000 WindowSize to calculate -s STEPSIZE, --step=STEPSIZE default:1000 StepSize for slide widows
2022-03-30 16:28:46 9KB Python
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Evol2Circos 提供了一个基于工具的用户友好平台,用于分析用户特定数据以进行同线构建和可视化,以及一个基于网络的平台,使用 Circos 图、条形图、双线图和点图方便浏览不同鱼类的同线信息。 Evol2Circos 生成的信息也可用于进一步的下游分析。
2022-02-19 09:45:10 61.2MB 开源软件
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Circos.pdf
2021-09-21 10:14:10 3.27MB circos
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详细的circos教程,从环境设置、软件安装到代码使用非常齐全,是绘制基因组共线性关系图的好帮手!
2021-09-18 14:49:34 4.36MB Circos 详细操作流程
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CIRCOS:The Beauty of Circle_杨振涛@vivo.pdf
2021-08-24 15:06:17 5.39MB CIRCOS
circos系列教程合集(1~4) pdf
2021-03-30 14:55:14 4.56MB circos教程
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考虑到circos在windows环境下安装过程比较复杂,花时间比较久,所以这里把安装需要用到的perl编译环境和circos软件,已经运行必须的模块都下载打包。但是文件过大不能上传,所以只能上传核心部分,要自己下载和运行strawberry perl的.msi文件,安装perl编译环境后,然后解压circos就可以直接使用,不需要再下载模块等繁琐步骤。
2019-12-21 21:24:55 16.63MB circos
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