Lambar_Spine_Slicer
腰椎影像智能分割可视化系统,采用Vue+Django框架,3DUNet算法自动分割nii医疗影像文件,并且可以在前端生成分割后的部位三维建模的模型。
框架
在pycharm中运行Djsngo文件即可
前端代码在Vue中修改,默认8888端口
下载
下载相关依赖库
numpy
SimpleITK
nibabel
scipy
pytorch
训练
训练时将训练集和测试集的数据和标签文件名称存在txt文件中,dataset类中获取数据 ,在utils类中处理数据
处理操作:
ct影像阈值截断
归一化
缩小分辨率
使用dice值评估分割的准确率
config文件中设置相关参数
设置训练的模型大小,每次在输入文件中截取该大小的部分进行训练。
可以加上attention机制提高准确率
三维建模
将nii转为stl模型文件展示椎间盘,神经根,类囊膜渲染在前端
引用
1