测序技术推进科学研究的发展。随着第二代测序技术的迅猛发展,科学界也开始越来越多地应用第二代测序技术来解决生物学问题。比如在基因组水平上对还没有参考序列的物种进行从头测序(de novo sequencing),获得该物种的参考序列,为后续研究和分子育种奠定基础;对有参考序列的物种,进行全基因组重测序(resequencing),在全基因组水平上扫描并检测突变位点,发现个体差异的分子基础。在转录组水平上进行全转录组测序(whole transcriptome resequencing),从而开展可变剪接、编码序列单核苷酸多态性(cSNP)等研究;或者进行小分子RNA测序(small RNA sequencing),通过分离特定大小的RNA分子进行测序,从而发现新的microRNA分子。在转录组水平上,与染色质免疫共沉淀(ChIP)和甲基化DNA免疫共沉淀(MeDIP)技术相结合,从而检测出与特定转录因子结合的DNA区域和基因组上的甲基化位点。
2023-03-28 11:01:06 17.75MB 高通量测序
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测序技术推进科学研究的发展。随着第二代测序技术的迅猛发展,科学界也开始越来越多地应用第二代测序技术来解决生物学问题。比如在基因组水平上对还没有参考序列的物种进行从头测序(de novo sequencing),获得该物种的参考序列,为后续研究和分子育种奠定基础;对有参考序列的物种,进行全基因组重测序(resequencing),在全基因组水平上扫描并检测突变位点,发现个体差异的分子基础。在转录组水平上进行全转录组测序(whole transcriptome resequencing),从而开展可变剪接、编码序列单核苷酸多态性(cSNP)等研究;或者进行小分子RNA测序(small RNA sequencing),通过分离特定大小的RNA分子进行测序,从而发现新的microRNA分子。在转录组水平上,与染色质免疫共沉淀(ChIP)和甲基化DNA免疫共沉淀(MeDIP)技术相结合,从而检测出与特定转录因子结合的DNA区域和基因组上的甲基化位点。
2023-03-28 10:47:18 65.67MB 高通量测序
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Savant(高通量测序数据的基因组浏览器).rar
2023-01-30 15:58:37 4.32MB savant
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HTSlib是用于访问常见文件格式(例如的统一C库的实现,该文件格式用于高通量测序数据,并且是和使用的核心库。 HTSlib仅取决于 。 已知与gcc,g ++和clang兼容。 HTSlib实现了通用BAM索引,其文件扩展名为.csi (坐标排序的索引)。 HTSlib文件阅读器首先查找新索引,然后在缺少新索引的情况下查找旧索引。 该项目还包括流行的tabix索引器和bgzip压缩实用程序,该索引器同时对.tbi和.csi格式进行索引。 构建HTSlib 有关完整的详细信息,请参见 。 包含尚未提交到此存储库的生成文件,因此从Git存储库构建代码需要额外的步骤: autoreconf -i # Build the configure script and install files it uses ./configure # Optional but recommende
2021-12-24 05:02:25 1.63MB C
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测序技术推进科学研究的发展。随着第二代测序技术的迅猛发展,科学界也开始越来越多地应用第二代测序技术来解决生物学问题。比如在基因组水平上对还没有参考序列的物种进行从头测序(de novo sequencing),获得该物种的参考序列,为后续研究和分子育种奠定基础;对有参考序列的物种,进行全基因组重测序(resequencing),在全基因组水平上扫描并检测突变位点,发现个体差异的分子基础。在转录组水平上进行全转录组测序(whole transcriptome resequencing),从而开展可变剪接、编码序列单核苷酸多态性(cSNP)等研究;或者进行小分子RNA测序(small RNA sequencing),通过分离特定大小的RNA分子进行测序,从而发现新的microRNA分子。在转录组水平上,与染色质免疫共沉淀(ChIP)和甲基化DNA免疫共沉淀(MeDIP)技术相结合,从而检测出与特定转录因子结合的DNA区域和基因组上的甲基化位点。
2021-10-23 22:04:25 22.26MB 高通量测序
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行业分类-设备装置-Illumina平台高通量测序文库定量标准物质的制备方法.zip
2021-08-22 13:08:41 724KB 行业分类-设备装置-Illumi
关于现在基于二代测序分析的一些生物信息方面的实验方法和专业名词的由来。
2021-07-16 15:52:53 3.3MB 生物信息
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