蛋白质结构比对对理解蛋白质功能和进化关系非常重要。提出一种基于蛋白质残基的二面角的结构比对算法。通过动态时间规整算法比对二面角序列,来比较蛋白质的结构,拟合两蛋白结构距离的分布后,利用p-value来评价比对的好坏。主要结果有:利用动态时间规整算法计算得出的结构距离是一个很好的蛋白质结构相似性度量;结构距离服从参数为μ=94.769 7,σ=41.583 7,ξ=0.192 5的广义的极值分布;和其他结构比对算法相比,该算法比CTSS的搜索结果要好。
2022-01-27 10:14:19 936KB 论文研究
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用于sql server数据库的表和字段的分析比对,比较指定两个数据库的表或者指定两个表的字段。
2022-01-10 21:05:17 3.72MB sql 比较 结构比对
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Prodar是一个搜索应用程序,可查询PDB以获取候选结构比对。 搜索的输入是从标准(文本)PDB文件中读取的蛋白质骨架结构,返回的结果仅基于骨架的结构相似性,而与序列信息无关。 搜索速度非常快,通常不到一分钟即可搜索到PDB(包含在应用程序中)。 Prodar会识别部分匹配项,因此无论链的相对大小如何,查询结构的较小部分都可以与PDB中其他结构的部分进行匹配。 目的是使该工具自动识别原本不同的蛋白质结构中的共同结构域和基序。 然后可以使用其他工具在结构上对齐这些文件,以找到RMSD(Prodar会提出建议)。 Prodar鼓励采用互动式的发现方式,在此方式中搜索会Swift完善并重新运行。 结果可能令人惊讶!
2021-11-22 22:29:07 1GB 开源软件
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【程序说明】 1、本程序用来对Oracle数据库进行结构比较,支持在线数据库比较和 离线数据库比较方式; 2、连接数据库无须在本地配置数据库连接,直接通过IP和端口以及相 应的数据库名称进行连接; 3、纯绿色软件,无须安装,拷贝即可使用,不修改注册表等; 4、在WinXP SP3 及Win2003 SP2 环境下进行过测试,对于其他版本 Windows操作系统没有进行过测试,欢迎您将测试结果告诉我; 5、如果在运行的过程中发现异常,欢迎您将程序运行目录下自动产生 的OraDBCompPro.LOG发送给我
2021-11-09 15:41:11 2.39MB Oracle 结构比较 数据库
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DBCompare(数据库结构比对工具)
2021-08-28 11:38:43 177KB DBCompare 数据库结构比 对工具
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测试api的json数据,比对字段,层次结构,数量的工具类。
2019-12-21 18:52:11 3KB json比对
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