MITObim - 线粒体诱饵和迭代映射 版本 1.9.1（稳定 - 依赖于 MIRA 4.0.2）这个版本存档在 Zenodo 上： 1.6（稳定 - 依赖于 MIRA 3.4.1.1） 我们建议使用最新版本，但请参阅下面有关校对算法可用性的说明。 版权所有 Christoph Hahn 2012-2018 接触 我们鼓励用户将您对MITObim的任何疑问/意见/问题发布到我们的网上或。 或（在紧急情况下） 直接通过联系我。 我会尽量尽快回复你！ 如果几天之内没有收到我的回音，请再发送一次提醒！ 介绍 本文档包含有关如何使用 Hahn 等人中描述的 MITObim 管道的说明。 2013 年。完整的文章可以在找到。 如果您在工作中使用 MITObim，请引用这篇文章。 该管道最初是为Illumina数据开发的，但由于 MIRA 组装器的多功能性，MITObim 原则上也支持

肿瘤线粒体代谢研究进展，吴昊，应敏峰，肿瘤的特征是不受控制的生长和增殖, 很多癌基因的突变使得细胞代谢重编程来为这一过程提供能量和物质。多年前Otto Warburg发现肿瘤组�

灰飞虱两种基因型的线粒体DNA拷贝数比较 ，孙荆涛，洪晓月，【目的】前期种群遗传构研究发现灰飞虱种群中存在两种线粒体单倍型群HGI和HGII，两种单倍型群的地理分布与环境温度具有显著的相关�

[C60]富勒烯丙二酸衍生物对细胞质膜和线粒体膜的光诱导损伤作用，杨新林，陈霖，利用激光扫描共聚焦显微镜研究了在低功率（≤1mW）激光照射下二丙二酸[C60]富勒烯（dimalonic acid C60, DMA C60）对HeLa细胞的细胞质膜和线粒

荧光定量PCR精确检测人胚胎干细胞线粒体DNA拷贝数方法的建立，孙懿，曾思聪，建立一种精确定量人胚胎干细胞线粒体DNA 拷贝数的方法。构建包含线粒体DNA ND1和核单拷贝基因β-globin基因序列的重组质粒作为标准品；�

mitobim最早应用于线粒体基因组的组装，现在也可用在核基因的组装，该软件需要在linux系统下运行

mitoMaker是基于原始NGS读数和可选的目标参照物而开发的用于简化线粒体基因组的组装和自动注释的管道脚本。 mitoMaker调用了诸如SOAPdenovo，MIRA和blast +之类的众所周知的汇编器和算法，并对它们的结果进行了解析，从而提供了易于读取的输出，例如FASTA，GENBANK，SEQUIN，PNG等。 通用管道：具有不同k-mer值的1迭代De Novo装配，试图装配与给定的靶线粒体基因组匹配的构建。 2-搜索所有线粒体基因特征和环化。 3存储找到的最佳结果。 4-使用MIRA和MITObim，将最佳装配用作基于参考的装配的主干，以尝试扩大有丝分裂基因组并缩小缺口。 5标注最佳装配，标识每个特征的开始和结束位置。 6-创建一个包含所有结果的文件夹（PNG，GENBANK，FASTA，SEQUIN，CAF，MAF和统计日志文件）。

缅甸蟒线粒体基因组全序列测定与分析.pdf

海南与越南缅甸蟒线粒体控制区遗传多样性及差异性分析.pdf

为探明中国羊毛尾线虫（Trichuris ovis）广东分离株线粒体核糖体大亚基基因（rrnL）的部分序列（prrnL）的遗传变异情况，用prrnL序列构建其与其他毛尾线虫的进化关系；应用聚合酶链反应（PCR）扩增羊毛尾线虫虫株的 prrnL，将所获得的序列用ClustalX 1.81程序进行比对，然后用PAUP 4.0 Beta 10程序MP法绘制种系发育树。结果表明：所获得的prrnL序列长度为849～850 bp，种内变异在0～0.8%；13个羊毛尾线虫分离株位于同一分支，羊毛尾线虫prrnL序列种