在这项研究中，从日本的天然水生环境中分离并鉴定了具有广泛pH耐受性的酵母。 尽管工业需求尚未得到满足，但仅报道了一些耐碱酵母的基础和应用研究。 首先，我们调查了pH 7.6-9.4的天然水生环境中的耐碱酵母。 我们从7个属和9个物种中分离了35个在pH 9.0培养基中生长的酵母菌株：25个菌株（N1，N2，通过N6，N9，K1，K3到K19）是Rhodotorula mucilaginosa； 一株（N7）为河豚假单胞菌； 其中一株（N8）是斯氏杆菌。 其中两个（N10和N13）是异常Wicherhamonyces。 其中一个（N11）是Saberus； 一个（S1）是Candida sp .； 两个（S2和S4）是中间念珠菌； 一个（S3）是假丝酵母。 一个（K2）是隐球菌液化。 我们检查了pH对代表性酵母菌株生长的影响。 菌株K12和S4在pH 3-10下显示高生长。菌株N7，N8，N10，N11和S3在pH 3-9下显示高生长。菌株K2和S1在pH 4-8下显示高生长。该菌株具有从pH 3-5的酸性介质到pH 6-8的中和活性。我们先前从极端酸化的环境中分离了耐酸酵母（隐球菌T1

对应博客：IQtree：使用 SNP 数据（vcf file）构建系统发育树

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EGA: Molecular Evolutionary Genetics Analysis MEGA is an integrated tool for automatic and manual sequence alignment, inferring phylogenetic trees, mining web-based databases, estimating rates of molecular evolution, and testing evolutionary hypotheses. 免费分子进化遗传分析软件，也是文献中经常用到的软件。该版本对使用界面做了优化，并有多种统计学算法。

系统发育分析是研究物种进化和系统分类的一种方法，研究对象为携带遗传信息的生物大分子序列，采用特定的数理统计算法来计算生物间的生物系统发生的关系。并用系统进化树来概括生物间的这种亲缘关系。

一、基于距离的系统发育树构建方法 （一）非加权分组平均法 UPGMA主要适用于在基因替代速率恒定时，尤其是用基因频率数据来构建分子系统发育树时。

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