matlab计算相关系数代码JHU_Bootcamp:Ahrenslab
这是由
Ahrens
实验室于
2017
年
8
月
22
日在
HHMI
Janelia
举办的
JHU
训练营课程的
github
存储库。
导师:Takashi
Kawashima
和
Mika
Rubinov
本课程的目标是学习大规模钙成像实验的数据分析基础知识。
在我们的实验中,约
100,000
个神经元的钙活动同时记录在斑马鱼幼虫的大脑中,斑马鱼在虚拟现实环境中行为[参考
1-3]。
在本课程中,我们使用
Matlab
作为编程环境。
我们使用
JHU_demo.mlx
来演示和练习数据分析。
成像数据集可以从
thd
dropbox
()
下载。
在这个实验中,鱼会根据环境中出现的各种视觉刺激改变其游泳模式。
我们分析了单个神经元的活动如何根据不同的行为变量(游泳模式、视觉刺激)进行调整,以及它们如何根据调整情况在大脑中分布。
下面是演示代码(“JHU_demo.mlx”)的一个例外。
您可以在代码中找到更详细的解释。
数据分析
首先,我们加载行为变量、神经元活动和神经元位置的数据。
root_d
2022-12-28 15:53:53
6.36MB
系统开源
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