Pyclamp 是用于提取和分析电生理数据的 Python 包。 已经开发了一个图形用户界面,允许用户在不需要任何 Python 代码知识的情况下运行该包。 目前,Pyclamp 旨在对诱发突触React进行非常具体的分析: 数据分析(开发中):这是一个高度用户交互的环境,可用于区分突触事件,获得其动力学的各种测量值和大小,并输出结果。 量子分析:该包的这一部分执行简单的方差均值分析和贝叶斯量子分析,以估计释放位点的量子大小和其他度量。
2022-08-27 17:22:28 2.22MB 开源软件
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连续傅里叶变换matlab代码电生理学 一些用于进行电生理数据集分析的最小Matlab代码。 入门 最好的选择是看一下包含典型用例的要点: getting_started_spikes显示了一个简单的示例,该示例加载峰值数据并在PSTH上绘制。 getting_started_LFP说明了绘制时间/频率图的过程。 加载Plexon数据 为了从Plexon文件加载数据, gplx_load , gplx_events_to_fields和gplx_event_ts_byname简化并简化了该过程。 但是,它们要求在您的系统上安装Plexon(对于非Windows用户,可能需要编译)。 请注意,这些功能仅用于处理原始的PLX格式文件,而不用于处理较新的PL2格式。 样本数据 文件sample_events , sample_spikes和sample_lfp都包含用于测试和运行sample_lfp示例数据。 加工钉 通常,峰值会从文件中加载为时间戳数组。 功能eventRaster , loopyPSTH和looplessPSTH处理将这些以分级放电数,通常与选项来选择围绕一组给定事件的时
2022-02-18 21:44:24 1.54MB 系统开源
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matlab画光谱代码地涌 Groundswell是Matlab应用程序,用于浏览和分析电生理数据(可选地与视频数据配合使用)。 它是由Adam L. Taylor在Stefan R. Pulver的指导下开发的,而Pulver博士是HHMI Janelia的研究员。 系统要求 Matlab R2013b或更高版本(64位) 安装 将.zip文件解压缩到您选择的位置。 在Matlab中,转到“文件”>“设置路径...”。 删除较旧版本的Groundswell的所有路径。 仍然在“文件”>“设置路径”中,单击“使用子文件夹添加...”,然后选择在解压缩.zip文件时创建的Groundswell-release_(无论如何)文件夹。 重新启动Matlab。 在Matlab提示符下键入“ groundswell”或“ roving”以运行所需的应用程序。 版权 除非另有说明,否则Groundswell中的所有代码,文档,图像以及其他任何内容均由Adam L. Taylor版权所有,2009-2017。 会费 Groundswell包含来自TIFFStack项目()的代码。 该代码具有不同的版
2022-02-09 22:09:50 1.51MB 系统开源
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matlab导入excel代码关于 ELEcro是查看电生理数据的简单工具。 我们创建了此工具来分析来自TMSi polygraphy equipment _的数据。 ELEcro可以以TMS32(.S00),EDF(.EDF)和BrainVision Analyzer文件格式(.VHDR)读写数据。 该软件的优点和缺点在于它的简单性。 它的速度非常快,但仅具有我们学习中通常需要的功能。 编译中 此处提供的源代码可以使用编译用于Windows,Linux或macOS。 入门 只需启动ELEcro并使用File / Open命令打开您的数据。 您可以使用菜单和时间滑块查看数据。 还有一些捷径: 鼠标滚轮:增大或减小垂直比例。 向上/向下箭头:增大或减小垂直比例。 左/右箭头:滚动时间段。 Ctrl-H / Ctrl-Alt-H:增大或减小水平比例。 Home / End:转到第一个或最后一个样本 鼠标右键单击并拖动:平移查看窗口。 将鼠标移到图像上会在图像的左侧生成文本,显示所选位置的时间采样和信号电平。 采集数据 您将需要使用测
2021-10-03 10:09:39 257KB 系统开源
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EEGLAB是一个交互式Matlab工具箱,用于处理连续和事件相关EEG、MEG和其他电生理数据,其中包括独立分量分析(ICA)、时间/频率分析、伪影抑制、事件相关统计以及多个有用的平均和单次试验数据的可视化模式
2021-08-19 14:45:58 42.17MB eeglab matlab eeg 电生理
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matlab分时代码聚乙二醇 用于检测和验证电生理数据中的相位幅度耦合(PAC)的MATLAB脚本。 由...撰写和维护,2017年6月-2019年10月。 手稿与引文 如果使用这些脚本,请引用: Seymour, R. A., Rippon, G., & Kessler, K. (2017). The Detection of Phase Amplitude Coupling During Sensory Processing. Frontiers in Neuroscience 11, 487. https://doi.org/10.3389/fnins.2017.00487 PAC功能 pacMEG.m函数可用于创建相位x幅度协调制图,用于按试验x时间矩阵排列的数据: % %%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%% % PACmeg: a function to do PAC % % Author: Robert Seymour (robert.seymour
2021-08-11 14:11:54 37.47MB 系统开源
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EEGLAB是一个交互式Matlab工具箱,用于处理连续和事件相关EEG、MEG和其他电生理数据,其中包括独立分量分析(ICA)、时间/频率分析、伪影抑制、事件相关统计以及多个有用的平均和单次试验数据的可视化模式
2021-07-03 09:02:31 42.17MB eeglab Matlab 电生理数据 EEG