阿伏加德罗 Avogadro是一款先进的分子编辑器,设计用于计算化学,分子建模,生物信息学,材料科学及相关领域中的跨平台使用。 它提供了灵活的呈现和强大的插件体系结构。 跨平台:适用于Windows,Linux和Mac OS X的分子构建器/编辑器。 免费,开源:易于安装,所有源代码都可以在GNU GPL下获得。 国际性:翻译成25种以上的语言,包括中文,法语,德语,意大利语,俄语和西班牙语,还有更多语言可供选择。 直观:专为学生和高级研究人员而设计。 快速:支持多线程渲染和计算。 可扩展:开发人员的插件架构,包括渲染,交互式工具,命令和Python脚本。 灵活:功能包括Ope
2024-08-23 11:45:12 17.38MB visualization windows linux mac
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DNA分析软件DNASP64位
2024-07-05 16:01:56 6.57MB 生物信息学
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用Perl编写的生物信息学工具 这里的大多数脚本是在我从事不同项目时编写的,我认为这对其他人将很有用,并且可以根据需要进行扩展/修改。 IO ::常规 脚本使用自定义 Perl模块。 请通过浏览目录查看安装说明。 如果要安装lncRNApipe Pipeline,则会自动安装IO::Routine模块。 需要Bio::SeqIO模块已安装且可用。 nc lncRNA管道 从头开始提取推定的新型lncRNA的管道,其中提供了从深度测序数据(例如:RNA-Seq)和注释数据组装而成的GTF格式的转录本列表。 转到目录以获取脚本列表。 安装lncRNApipe及其所有依赖项(Mac和
2024-04-11 16:13:10 325.53MB bioinformatics pipeline perl mirna
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乌根 下载UGENE: ://ugeneunipro.github.io/ugene/ 建筑UGENE 先决条件 确保已安装Qt(> = 5.4.2和<= 5.15)开发库: 我们强烈建议您使用Qt在线安装程序将Qt安装到任何操作系统上。 这是Windows和macOS操作系统(也适用于Linux)的主要方式。 要安装Qt,请从Qt官方网站( )下载在线安装程序。 确保已安装以下组件: Qt Prebuild组件 Qt脚本 安装Qt的其他选项: Ubuntu> = 14.04:`sudo apt-get install qt5-default qttools5-dev-tools qtscript5-dev libqt5svg5-dev Ubuntu 12.04: 下载并安装Qt 5.5.1: 设置系统变量:export PATH = $ PATH:〜/ Qt5.5.1 / 5.5 / gcc_64 / bin sudo apt-get install g++ libgl1-mesa-dev libglu1-mesa-dev Fedora: sudo yum ins
2024-01-12 16:27:58 27.73MB science workflow bioinformatics cross-platform
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脂蛋白是从家畜衍生的过敏原之一,对过敏反应的发展具有临床重要性。 它们在不同的动物中都有特征。 具有致敏能力的特征,对于涉及过敏反应的表位知之甚少。 在这里,通过生物信息学工具探索了脂蛋白之间交叉反应的潜在抗原区域。 通过系统发育研究,使用了来自不同家畜(小鼠,狗,猫,公牛,仓鼠,马和猪)的几种脂蛋白的氨基酸序列来确定亲缘关系。 通过使用MEGA软件获得具有最高系统发育关系的组。 通过同源性对未在蛋白质数据库中报告的脂蛋白的3D模型进行建模,以识别在这组过敏原的交叉反应性中受损的潜在抗原区域。 变应性脂蛋白的整个数据库和推断的最大似然树的比对将脂蛋白分为五个单系进化枝(此处称为A,B,C,D和E)。 根据多重配对分析,C组(Fel d 4,R​​at n 1和Equ c 1)在其氨基酸序列中显示出最高的同一性(58%)。 对保守和暴露残基的分析表明,C组共有三个抗原性区域,可能会促进其交叉反应。 确定了潜在的抗原性位点,用于在本研究中分析的不同脂钙蛋白之间产生交叉反应。 这些研究支持进行定向诱变测试以确认其与脂蛋白的致敏能力的相关性的需要。
2024-01-11 17:37:42 3.33MB 生物信息学
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河豚白细胞介素-2基因鉴定及其生物信息学分析,董伟仁,邵健忠, 利用比较基因组学方法,在河豚(Takifugu rubripes)基因组中鉴定了IL-2基因(FrIL-2)。该基因为单拷贝基因,由4个外显子和3个内含子组成
2024-01-11 08:58:23 344KB 首发论文
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该书从基因、RNA、蛋白质、表观遗传学四个方面介绍计算生物学和生物信息学知识、案例。作者是Ka-Chun Wong。该电子书文字可复制。
2024-01-10 15:10:38 7.38MB 计算生物学 生物信息学 表观遗传学
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小菜蛾肽聚糖识别蛋白的生物信息学分析,梁昊,黄斌,肽聚糖识别蛋白参与生物体的免疫过程,在昆虫抵抗病原菌入侵和免疫信号通路中具有非常重要的作用。为了深入研究小菜蛾(Plutella xyl
2024-01-10 13:28:36 533KB 首发论文
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生物人初学生物信息学的书籍,所以请多多下载
2023-10-09 12:42:01 13.91MB 生物信息学 傻瓜
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pymol开源安装方案链接,及其说明,以及相关依赖包
2023-04-23 15:24:25 207.25MB 生物信息计算 pymol
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