盖西 用于基因组富集分析的R包
2022-01-20 11:20:02 9.26MB R
1
GSEApy GSEApy:Python中的基因集富集分析。 有关使用GSEApy的示例,请单击此处: 发行说明: : 常见问题解答: GSEApy是GSEA和包装器Enrichr Python实现。 GSEApy可用于RNA序列,ChIP序列,微阵列数据。 它可用于方便的GO富集并以python生成出版物质量数据。 GSEApy有六个可用的子命令: gsea , prerank , ssgsea , replot enrichr , biomart 。 gsea: gsea模块产生GSEA结果。 输入以gmt格式查询txt文件(FPKM,预期计数,TPM等),cls文件和gene_sets文件。 预排名: prerank模块产生预排名工具结果。 输入期望以.rnk格式提供的具有相关值的预排序基因列表数据集,并以gmt格式提供gene_sets文件。 prer
2021-12-09 14:24:08 4.18MB go enrichment-analysis gsea Python
1
WGCNA是用于生物信息处理的R包软件,可对基因组、转录组等测序数据进行富集化分析,通过差异化的基因表达建立基因与特异性之间的联系。
2021-10-21 17:40:45 3.29MB WGCNA 基因数据分析 富集分析
1