蕨菜2.6丰度估计
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Bracken的同行评审论文(2017年1月2日发布): :
安装
Bracken是Kraken 1或Kraken 2的配套程序,而Kraken在分类树中将读取分类为多个级别,而Bracken允许使用这些分类在单个级别上估计丰度(例如Bracken可以估计样本中物种的丰度)。
在安装Bracken之前,请先安装Kraken:可从此处下载Kraken: :
轻松安装Bracken:
bash install_bracken.sh
硬蕨安装:
cd src/ && make
Add bracken/bracken-build and scripts in src/ to your PATH
重要信息:蕨菜与MPA风格的报告不兼容。 Bracken需要kraken / kraken2中的默认报告格式。
蕨菜2.5.
2022-02-22 13:15:40
146KB
C++
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