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SubGNN:子
图神经网络
(NeurIPS 2020)
子神经网络 NeurIPS 2020论文存储库: 作者: , ,, 要使用SubGNN,请执行以下操作: 安装环境 准备数据 在config.py修改PROJECT_ROOT 修改适当的config.json文件 训练和评估SubGNN 安装环境 我们提供了一个yml文件,其中包含SubGNN的必要软件包。 一旦安装了 ,就可以创建如下环境: conda env create --file SubGNN.yml 准备数据 通过(1)下载我们提供的数据集或按照prepare_dataset文件夹README中的步骤来为SubGNN准备数据,(2)生成合成数据集或(3)格式化您自己的数据。 真实数据集:我们将发布四个新的真实数据集:HPO-NEURO,HPO-METAB,PPI-BP和EM-USER。 您可以 从Dropbox下载这些文件。 您应该解压缩文件夹并将config.py的P
2025-10-21 11:52:49
87KB
embeddings
graph-neural-networks
Python
1
一种基于属性和
图神经网络
的推荐算法——本科生毕设.zip
【项目资源】: 包含前端、后端、移动开发、操作系统、人工智能、物联网、信息化管理、数据库、硬件开发、大数据、课程资源、音视频、网站开发等各种技术项目的源码。 包括STM32、ESP8266、PHP、QT、Linux、iOS、C++、Java、python、web、C#、EDA、proteus、RTOS等项目的源码。 【项目质量】: 所有源码都经过严格测试,可以直接运行。 功能在确认正常工作后才上传。 【适用人群】: 适用于希望学习不同技术领域的小白或进阶学习者。 可作为毕设项目、课程设计、大作业、工程实训或初期项目立项。 【附加价值】: 项目具有较高的学习借鉴价值,也可直接拿来修改复刻。 对于有一定基础或热衷于研究的人来说,可以在这些基础代码上进行修改和扩展,实现其他功能。 【沟通交流】: 有任何使用上的问题,欢迎随时与博主沟通,博主会及时解答。 鼓励下载和使用,并欢迎大家互相学习,共同进步。
2025-04-24 12:46:52
4.19MB
毕业设计
课程设计
项目开发
资源资料
1
MSRC-9数据集
图神经网络
图神经网络
GNN数据集,计算机视觉领域数据集,共有221张图,八分类,平均节点数为40,平均边数为97
2024-07-28 16:49:12
187KB
神经网络
数据集
图神经网络
深度学习
1
PTC-FM数据集
图神经网络
图神经网络
(Graph Neural Networks, GNN)是深度学习领域中的一个重要分支,它专注于处理非欧几里得数据,如图结构数据。在本数据集“PTC-FM”中,我们聚焦于小分子的图表示和二分类任务。这个数据集包含349个图,每个图代表一个化学分子,其结构信息被抽象成节点和边的形式。平均每个图有14个节点,这通常对应于分子中的原子,而平均14条边则代表原子间的化学键。
图神经网络
的工作原理是通过不断迭代地传播和聚合邻居节点的信息,从而对每个节点进行特征学习。在每一轮迭代(也称为消息传递层)中,每个节点的特征向量会与相邻节点的特征向量进行交互,然后更新自身的状态。这个过程可以理解为在图中传播信息,直到达到一个稳定状态或达到预设的迭代次数。通过对图中所有节点特征的汇总,可以得到整个图的全局表示,用于执行分类或其他下游任务。 对于小分子分析,GNN特别适合,因为它能捕获分子的拓扑结构和化学键信息。在PTC-FM数据集中,GNN模型可以学习识别分子结构与特定属性(例如,是否有毒性)之间的关系。二分类任务意味着模型需要区分两类不同的分子,比如有毒和无毒。 为了构建这样的模型,首先需要将分子结构数据转化为图的形式,其中节点代表原子,边代表化学键。然后,每个节点可以有初始特征,如原子类型,而边可能也有附加信息,如键的类型。在训练过程中,GNN模型会学习这些特征并利用它们进行分类。 在实际应用中,GNN模型的构建通常涉及以下步骤: 1. **数据预处理**:将分子结构数据转换为图表示,包括节点和边的初始化。 2. **定义GNN层**:设计消息传递函数和节点/图聚合函数。 3. **模型架构**:搭建多层GNN网络,并可能结合其他深度学习组件如全连接层。 4. **训练与优化**:通过反向传播算法更新模型参数,以最小化损失函数。 5. **评估与验证**:使用交叉验证或者独立测试集评估模型性能。 在这个数据集上,你可以尝试多种GNN变体,如Graph Convolutional Network (GCN)、Graph Attention Network (GAT) 或 Message Passing Neural Network (MPNN),并比较它们的性能。此外,可以考虑集成其他技术,如节点嵌入、图池化或图自编码器,以增强模型的表达能力和泛化能力。 PTC-FM数据集为研究和开发
图神经网络
提供了宝贵的资源,有助于推进化学信息学、药物发现和机器学习在物质科学领域的应用。通过深入理解和应用GNN,我们可以更好地理解和预测分子的性质,这对于新药研发、材料科学等领域具有重大意义。
2024-07-28 16:48:31
69KB
神经网络
数据集
图神经网络
机器学习
1
毕业设计:基于
图神经网络
的异构图表示学习和推荐算法研究.zip
【毕业设计:基于
图神经网络
的异构图表示学习和推荐算法研究】 本毕业设计主要探讨了
图神经网络
(GNN)在异构图表示学习和推荐系统中的应用。
图神经网络
是一种强大的机器学习模型,它能处理非欧几里得数据结构,尤其适用于社交网络、知识图谱和复杂网络等领域的分析。在异构图中,不同类型的节点和边共同构成了复杂的网络结构,这为理解和挖掘数据间的关系提供了新的视角。 一、
图神经网络
基础 1.
图神经网络
的定义:GNN 是一种对图数据进行深度学习的方法,通过消息传递机制在节点之间传播信息,从而学习节点的嵌入表示。 2. 模型结构:GNN 包含多层神经网络,每层通过聚合邻居节点的信息更新当前节点的状态,直到收敛或达到预设层数。 3. 消息传递:GNN 的核心是消息传递函数,它负责将一个节点的特征向量传递给其相邻节点,同时接收来自邻居节点的信息。 二、异构图表示学习 1. 异构图的特性:异构图包含多种类型节点和边,每种类型都有不同的属性和交互模式。 2. 表示学习挑战:如何在异构环境中有效地捕获不同类型节点和边的特征并进行统一表示,是异构图学习的关键。 3. GNN 在异构图中的应用:通过设计适应异构图的GNN模型,如Heterogeneous Graph Neural Network (HetGNN)、Metapath2Vec等,可以处理节点和边的多样性,捕捉丰富的语义信息。 三、推荐算法 1. 推荐系统概述:推荐系统旨在预测用户可能感兴趣的内容,通过分析用户历史行为、兴趣偏好等数据来实现个性化推荐。 2. 基于图的推荐:将用户、物品等视为图中的节点,通过GNN学习节点间的关系,进而预测用户可能的评分或点击概率。 3. 异构图在推荐中的优势:能够捕获用户-物品、用户-用户、物品-物品等多类型关系,提升推荐的准确性和多样性。 四、项目实现 本设计提供了一个完整的实现框架,包括数据预处理、模型训练、评估和推荐结果生成等环节。源码经过严格测试,确保可直接运行,为其他研究者或学生提供了参考和实践平台。其中,"demo"可能是演示代码或样例数据,帮助理解模型的运行流程和效果。 五、互动支持 作者承诺对下载使用过程中遇到的问题及时解答,保证良好的使用体验。这种互动交流有助于深化对项目的理解,提高问题解决能力。 本毕业设计深入研究了GNN在异构图表示学习和推荐算法中的应用,不仅涵盖了理论知识,还提供了实际操作的代码,对于学习和研究
图神经网络
在推荐系统中的应用具有重要价值。
2024-07-28 09:14:58
579KB
毕业设计
1
图神经网络
学习资料、ppt、论文
入门
图神经网络
的好资源,了解GNN的基本原理,训练方法,以及其各种变体的应用。通俗易懂,讲解全面。入门
图神经网络
的好资源,了解GNN的基本原理,训练方法,以及其各种变体的应用。通俗易懂,讲解全面。
2024-05-22 19:41:49
47.73MB
图神经网络
神经网络
深度学习
1
图神经网络
的初认识及代码
图神经网络
的初认识及代码
2024-04-21 14:39:22
55KB
神经网络
人工智能
深度学习
机器学习
1
深度学习-
图神经网络
实战
分享一套
图神经网络
视频教程——《深度学习-
图神经网络
实战》,视频+源码+数据+文档资料下载! 《深度学习-
图神经网络
实战》课程旨在帮助同学们快速掌握深度学习在图模型领域算法及其应⽤项⽬。内容主要包括三个模块: 1、图神经⽹络经典算法解读,详细解读GNN,GCN,注意⼒机制图模型等算法 ; 2 、图神经⽹络框架PyTorch-Geometric,全程实战解读图神经⽹络框架应⽤⽅法; 3 、图神经⽹络项⽬实战,基于真实数据集与实际项⽬展开图数据集构建与模型训练并应⽤到实际场景中。 整体⻛格通俗易懂,提供全部数据与代码。
2023-05-19 18:57:42
1KB
深度学习
pytorch
pytorch
神经网络
1
SuperGluePretrainedNetwork:SuperGlue:与
图神经网络
匹配的学习功能(CVPR 2020,口腔)
研究@ Magic Leap(CVPR 2020,口腔) SuperGlue推理和评估演示脚本 介绍 SuperGlue是在Magic Leap完成的2020 CVPR研究项目。 SuperGlue网络是一个图形神经网络,结合了最佳匹配层,该层经过训练可以对两组稀疏图像特征进行匹配。 此存储库包含PyTorch代码和预训练权重,用于在关键点和描述符之上运行SuperGlue匹配网络。 给定一对图像,您可以使用此存储库在整个图像对中提取匹配特征。 SuperGlue充当“中端”,在单个端到端体系结构中执行上下文聚合,匹配和过滤。 有关更多详细信息,请参见: 全文:PDF: 。 作者: Pa
2023-04-15 00:59:43
114.85MB
deep-learning
pose-estimation
feature-matching
graph-neural-networks
1
深度学习-
图神经网络
实战课
给大家分享一套课程——《深度学习-
图神经网络
实战课》,提供全部数据与代码。 图神经⽹络模块课程旨在帮助同学们快速掌握深度学习在图模型领域算法及其应⽤项⽬。
2023-04-11 15:28:48
730B
神经网络
深度学习
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