viRome是一款基于R语言的开源软件包,专门设计用于处理和分析病毒小RNA(viral small RNA,vsRNA)序列数据。在生物信息学领域,这类数据在研究病毒与宿主相互作用、病毒抑制机制以及免疫应答等方面具有重要意义。通过使用viRome,研究人员能够更高效地对这些复杂的序列数据进行清洗、比对、注释和可视化,从而揭示潜在的生物学信息。 viRome的主要功能包括: 1. 数据预处理:该包提供了一系列工具来清洗原始测序数据,去除低质量读段、接头序列和非病毒序列,确保后续分析的准确性。 2. 序列比对:viRome支持将处理后的vsRNA序列比对到已知的病毒基因组数据库,以便识别出它们可能源自的病毒种类。 3. 注释与统计:通过比对结果,viRome可以对每个序列进行注释,如来源病毒、定位区域等,并进行统计分析,例如计算每种病毒的丰度,探索不同样本间的差异。 4. 可视化:viRome包含多种可视化工具,如热图、条形图和散点图,帮助用户直观地展示vsRNA的分布、长度分布、病毒种类丰度等信息,有利于发现潜在的模式和趋势。 5. 动态交互:viRome的可视化功能还支持交互式操作,用户可以调整参数,实时查看分析结果的变化,便于深入探究数据。 6. 兼容性:viRome针对不同的R版本有不同的兼容性要求,对于R 2.x版本,推荐使用0.7或更低版本,而对于R 3.x及更高版本,建议使用0.8或更新的版本,以充分利用新版本R的优化和改进。 7. 开源社区:作为开源软件,viRome的源代码可供公众查看和修改,用户可以根据自身需求进行定制开发,同时,社区中的其他用户和开发者可以共享改进和新功能,促进软件的持续更新和优化。 viRome为病毒小RNA数据分析提供了一个全面而便捷的解决方案,无论是对于学术研究还是临床应用,都能大大提高效率,促进我们对病毒感染和宿主响应的深入理解。使用viRome时,用户应根据自身的R环境选择合适的版本,并结合提供的文档和示例进行学习和应用,以充分发挥其潜力。
2024-10-22 16:00:18 7.16MB 开源软件
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包装器 OpenCL Wrapper for C++ 提供对上下文和队列管理、内存分配/释放和内核调用的更轻松访问。 ###特征 当超出范围时,内存缓冲区将自动释放自己。 缓冲区类型被模板化以显示它们预期包含的类型。 缓冲区可以设置为在被内核修改或手动操作时自动将内容检索到主机存储。 还自动创建事件以允许在单独的队列中自动执行所有内存同步,这允许在任何可能的情况下自动异步内存传输。 包括使用 Boost.Test 验证包装器是否正常工作的第二个项目。
2024-08-27 14:46:02 26KB
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PdfiumViewer github上是这样介绍的: PdfiumViewer 是一个基于 PDFium 项目的 PDF 查看器。 PdfiumViewer 提供了许多组件来处理 PDF 文件: • PdfDocument 是用于呈现 PDF 文档的基类; • PdfRenderer 是一个可以呈现 PdfDocument 的 WinForms 控件; • PdfiumViewer 是一个 WinForms 控件,它托管一个 PdfRenderer 控件并添加一个工具栏来保存 PDF 文件或打印它。
2024-08-05 15:31:56 12.08MB PdfiumViewer PDFium
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课设题目:包装生产线控制系统 文件内容:课设要求(指导书)、课设报告、程序、硬件CAD图(总体框图、主电路图、控制电路图、外部接线图)
2024-06-26 13:21:38 1.05MB PLC控制系统设计 PLC课程设计
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项目开发流程(不提不说,必须会背) 在我们项目立项以后,项目经理、研发部和产品部一起针对项目进行了需求分析会议。会议结束以后,产品部门会给我们研发部提供需求文档,然后我们研发部再进行开会分析这些需求,根据需求进行分组后,分组后再进行讨论、创建表、写排期等,开发文档我们使用是这个swagger自动生成API文档。然后就是和我们项目组长一块去搭建框架,然后提交到远程仓库master上,由组员进行拉取分支,接下来就是根据需求进行开发。 项目整体介绍 我最近做的一个项目是一个关于物流的项目,这个项目主要业务就是,用户物流在线下单,用户接单,可以根据用户所在的位置推荐最近的物流站点,可以根据用户的选择进行上门取件,送货上门。当时的时候,我是与项目组长和小组成员全程参与的架构设计,所以我就简单介绍一下上一个项目的架构。
2024-06-20 10:31:14 787KB java 交通物流 求职面试
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项目开发流程(不提不说,必须会背) 在我们项目立项以后,项目经理、研发部和产品部一起针对项目进行了需求分析会议。会议结束以后,产品部门会给我们研发部提供需求文档,然后我们研发部再进行开会分析这些需求,根据需求进行分组后,分组后再进行讨论、创建表、写排期等,开发文档我们使用是这个swagger自动生成API文档。然后就是和我们项目老大一块去搭建框架,然后提交到远程仓库master上,由组员进行拉取分支,接下来就是根据需求进行开发。 项目介绍: 最近我协同开发的项目是一个类似转转、咸鱼商城的二手商品平台,这个项 目主要是用于 B2C、C2C 在平台上做一些线上和线下的二手商品交易,还实现了商品搜索、热门推荐、用户爱好推荐、广告等功能 被动说 开发环境:IDEA+Mysql+JDK1.8+Git+Maven 相关技术:Redis 缓存、Mongodb 数据库、RocketMq、Nginx、ES,Freemarker、 Docker、Jekins 等 其他技术:阿里云 OSS、Quartz 等 由于当时小组人较少,我负责的模块就比较多些,包括购物车模块、闪拍模 块、
2024-06-20 10:26:03 916KB java 求职面试
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GB∕T 35010.3-2018 半导体芯片产品 第3部分:操作、包装和贮存指南.pdf
2024-06-19 20:12:03 3.03MB
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C#中的3D容器包装 这是一个C#库,可用于查找3D容器包装解决方案(也称为3D箱包装)。 它包括EB-AFIT打包算法的实现,该算法最初是由美国空军技术学院(AFIT)的ErhanBaltacıoğlu(EB)于2001年作为硕士论文开发的。该算法在《发行商的三维托盘》中也有描述包装问题:基于人类智能的启发式方法,作者:ErhanBaltacıoğlu,James T. Moore和Raymond R.Hill Jr.,于2006年发表在《国际运筹学杂志》上(第1卷,第3期)。 EB-AFIT算法支持整个项目轮换,并具有出色的运行时性能和容器利用率。 用法 首先在解决方案中包含ContainerPacking项目。 创建一个Container对象列表,该列表描述了容器的尺寸: List containers = new List();
2024-04-16 17:12:10 455KB
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react-pdf-js react-pdf-js提供了使用呈现PDF文档的组件。 演示版 用法 使用yarn add @mikecousins/react-pdf安装yarn add @mikecousins/react-pdf或npm install @mikecousins/react-pdf usePdf挂钩 使用应用程序中的钩子(还显示一些基本的分页): import React , { useState , useRef } from 'react' ; import { usePdf } from '@mikecousins/react-pdf' ; const MyPdfV
2024-04-10 16:36:53 201KB react pdf component es6
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快递包装回收的逆向物流网络优化研究-黄周.caj
2024-03-27 15:56:17 1.47MB
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