采用溶液聚合合成了苯乙烯-甲基丙烯酸缩水甘油酯-甲基丙烯酸甲酯三元共聚物扩链剂,考察了甲基丙烯酸缩水甘油酯添加量与扩链剂环氧当量的关系、反应温度与扩链剂重均相对分子质量和收率的关系以及扩链剂重均相对分子质量与扩链效果之间的关系。用红外光谱和示差扫描量热法(DSC)对扩链剂的结构和玻璃化温度进行了表征。

软件介绍: DNAMAN 9 英文注册版安装说明：1. 先双击Setup.exe安装原版，完成先不要运行DNAMAN；2. 复制DNAMAN.exe 复制到安装目录下（默认目录为C:\Program Files (x86)\DNAMAN\），替换同名文件即可；DNAMAN是一款专业的生物学软件，能够核苷酸序列，蛋白质序列等进行比对以及相应分析。

"分子动力学模拟 可视化 ovito-2.9.0" 涉及的是一个专业级别的分子模拟软件，Ovito。这个版本2.9.0是针对分子动力学模拟数据进行可视化处理的重要工具。Ovito在科学计算领域，特别是材料科学和化学中广泛应用，它能够帮助研究人员理解和分析复杂的分子结构和动态行为。 "增加了ovito Pro 版本的功能" 提示我们，这个版本相比于之前的Ovito基础版，增添了更多专业特性。这可能包括高级分析工具、增强的性能、新的可视化选项或者是用户界面的改进。Ovito Pro通常是为了满足那些需要更强大功能和更高效处理大量数据的专业用户设计的，这些新功能将提升科研人员的工作效率和研究深度。 "安装包" 暗示这是一个可以下载并安装在计算机上的程序。这个压缩包包含了所有必要的文件和组件，用户可以通过解压和按照指示进行安装，以在本地环境中运行Ovito软件。 【压缩包子文件的文件名称列表】： - `LICENSE.txt`: 这个文件通常包含软件的许可协议，详细说明了用户可以如何使用、分发和修改软件。对于开源软件，这可能是GPL、MIT或Apache等许可证。 - `README.txt`: 这是一个重要的文档，提供了软件的基本信息、安装指南、使用提示以及可能的故障排除步骤。 - `DLLs`: Dynamic Link Libraries，这是Windows操作系统中的共享库文件，包含可被多个程序调用的函数和资源。 - `plugins`: 插件文件夹，可能包含了Ovito支持的各种扩展功能，如特定的分析模块或者可视化特效。 - `doc`: 文档文件夹，通常包含软件的用户手册、API参考或其他教育材料，帮助用户更好地理解和使用Ovito。 - `Lib`: 库文件夹，可能包含了软件运行所必需的库文件和其他依赖。 Ovito-2.9.0是一个专为分子动力学模拟而设计的高级可视化工具，其Pro版本提供了额外的功能，以适应更复杂的研究需求。通过安装包提供的文件，用户不仅可以安装和运行Ovito，还能获取软件的使用许可信息、了解使用方法，并利用插件和库文件进行自定义和扩展。这对于科学家和工程师来说，是进行材料性质探究和分子模拟研究的强大助手。

采用分子模拟的方法研究表面活性剂的泡沫生成能力,以界面形成能作为考察泡沫体系中液膜界面积的量化依据,研究了泡沫液膜厚度、表面活性剂分子界面密度以及表面活性剂类型对泡沫液膜界面形成能计算的影响.通过与实验结果相对应,建立了界面形成能和泡沫生成能力之间的联系.

适用于lammps的扩展包QUIP，建立GAP势函数的必要文件。 A pair_style quip command which wraps the QUIP libAtoms library, which includes a variety of interatomic poten-tials, including Gaussian Approximation Potential (GAP) models developed by the Cambridge University group. To use this package you must have the QUIP libAtoms library available on your system. Author: Albert Bartok (Cambridge University)

基于结构的新双氯芬酸设计：理化、光谱、分子对接、动力学模拟和ADMET研究 本研究旨在设计新的双氯芬酸结构，以减少副作用，提高安全性。通过在核心结构的不同位置插入新的官能团，如CH3、OCH3、F、CF3、OCF3、Cl、OH、COOH、NH2、CH2NH2、CONH2、NHCOCH3，并进行几何优化、光谱计算和分子对接、动力学模拟、ADMET研究。 双氯芬酸是一个非甾体抗炎药，常用于镇痛、解热和抗炎治疗。然而，它也显示出一些严重的副作用，如对人体和其他生物的肾脏、胃肠道和心血管损伤。如果长期服用高剂量，它也会引起胃肠道副作用，如出血和穿孔。肝脏毒性也是与口服双氯芬酸相关的另一个问题。 为了提高其安全性，已经尝试设计一些新的潜在药物，以减少副作用，具有更好的药用作用。计算机辅助药物设计可以帮助设计新的药物结构，预测药物的生物学活性和毒性。 在本研究中，我们使用了计算机辅助药物设计、分子对接和动力学模拟来设计新的双氯芬酸结构。我们插入了新的官能团到核心结构的不同位置，并进行了几何优化和光谱计算。然后，我们使用分子对接和动力学模拟来预测蛋白-药物复合物的结合亲和力、键合作用和稳定性。 ADMET研究也被进行，以寻找新的双氯芬酸结构的药代动力学特性，如吸收、代谢和毒性。物理化学和光谱数据支持新的结构构象。分子对接和动力学研究揭示了药物作用的改善，药代动力学预测表明其副作用较母体药物降低且无致癌性。 本研究的结果表明，新的双氯芬酸结构具有更好的药用作用和安全性，降低了副作用的风险。这项研究为开发具有改善的临床安全性的新药提供了潜力。 此外，本研究还讨论了双氯芬酸的历史、药理学、药代动力学和毒理学特性，以及其在医疗中的应用和副作用。同时，本研究也强调了计算机辅助药物设计在药物研发中的重要性。 本研究旨在设计新的双氯芬酸结构，以减少副作用，提高安全性。本研究的结果表明，新的双氯芬酸结构具有更好的药用作用和安全性，降低了副作用的风险。这项研究为开发具有改善的临床安全性的新药提供了潜力。

分子印迹基质固相分散-液相色谱法测定水产品中的磺胺类抗生素残留，孟原，潘思静，以获得的对磺胺类抗生素（Sulfonamides, SAs）具有特异选择性的分子印迹聚合物（Molecularly imprinted polymers, MIPs）作为吸附材料，建立分子印�

化学领域中，分子量的准确计算是开展各类研究的基础。科研人员在进行化合物合成、分析化学反应平衡或探究同位素效应时，都离不开对分子量的精确把握。随着科技的进步，传统手工计算的方法已逐渐被电子计算机所替代，而专业软件的出现更是极大地提高了工作效率和准确性。《分子量计算器安装程序》便是这样一款应运而生的高效工具，它不仅满足了化学科研人员的基本需求，还提供了额外的辅助功能，极大地扩展了化学分析的深度和广度。 这款软件的核心在于能够快速准确地计算化学式中各元素的分子重量。它支持一次性处理多个化学式，相较于逐个手动计算的方式，效率得到了极大的提升。这种设计特别适合在需要处理大量化合物数据的情况下使用，例如合成化学、药物化学、材料科学等领域的研究工作，有效地节约了科研人员的时间和精力。 在分子量计算之外，这款软件还具备了显示化学式下标的功能。化学式中下标的重要性在于它表达了原子的数量和比例关系，对于理解和记录复杂的化学反应以及合成路径至关重要。《分子量计算器安装程序》通过在用户界面上直观地展现化学式下标，极大地提高了化学式表述的清晰度，有助于用户更加准确地解读和交流化学信息。 此外，计算同位素分布是该软件的另一大亮点。由于自然界中许多元素都存在同位素，科研人员在分析物质组成和性质时，需要考虑同位素的影响。该软件能够精确计算出含有不同同位素的化合物分子量，为化学反应分析和质量控制提供了可靠数据支持。这一功能对于研究者们理解同位素效应及其在化学合成和分析中的应用，起到了关键的作用。 软件的离子图像绘制功能则是拓展了其在质谱分析领域的应用。离子图像不仅能够直观地展示离子的结构，还能够模拟和分析实验数据，帮助科研人员理解反应路径和产物结构。这为质谱分析提供了强有力的辅助工具，增加了实验结果解释的准确性。 《分子量计算器安装程序》的其他附带文档如"RevisionHistory.txt"、"ReadMe.txt"和"SetupHelp.txt"，分别记录了软件的更新历史、基本使用说明和安装指南。这些文档对于用户快速掌握软件使用和遇到问题时进行排查提供了便利，尤其是对于初次使用者而言，这些文档显得尤为重要。 在学术研究中，这款软件无疑是一个不可多得的工具。其集实用性与先进性于一体，无论是在教学还是在专业研究中，都能发挥出显著的价值。《分子量计算器安装程序》简化了分子量计算的过程，强化了化学信息的可视化，对于提升化学领域的科研效率具有重要意义。用户只需按照提供的安装指南，便能轻松享受这一强大工具带来的便利。随着化学领域研究的不断深入，这款软件也将会继续更新完善，更好地服务于科研人员，推动化学科学的发展。

SurfDock 来源于中国科学院上海药物所的郑明月为通讯作者的文章：《SurfDock is a Surface-Informed Diffusion Generative Model for Reliable and Accurate Protein-ligand Complex Prediction》于2024 年 11 月 27 日正式发表在 《Nature Methods》上。在文章中，SurfDock 在多个基准测试中展现了卓越的表现，包括 PDBbind 2020 时间分割集、Astex Diverse 集和 PoseBusters 基准集。在模型中，SurfDock 将多模态蛋白质信息（包括表面特征、残基结构和预训练的序列级特征）整合成一个一致的表面节点级表示，这一能力对实现高对接成功率和改善构象合理性起到了重要作用。SurfDock 的另一个特点是其可选的弛豫（构象优化），旨在进行蛋白质固定配体优化，从而显著提高其准确性。 我们的测评结果显示，生成的小分子构象还是比较合理的，同时生成的结合模式与晶体非常接近。

IPDiff 是一个基于蛋白质-配体相互作用先验引导的扩散模型，首次把配体-靶标蛋白相互作用引入到扩散模型的扩散和采样过程中，用于蛋白质（口袋）特异性的三维分子生成。来源于文章 《Protein-Ligand Interaction Prior for Binding-aware 3D Molecule Diffusion Models》。文章链接： https://openreview.net/forum?id=qH9nrMNTIW 。 针对原GitHub中代码的问题与报错，本文档对原代码进行了修改，包含了完整的 IPDiff 项目，包含测试体系、可运行（修正报错）、可训练的源代码，并标注了每一个代码修改的位置。 此代码包含了完整的 IPDiff 的使用方法，可以针对某个某个蛋白体系的特定口袋生成结合力强的分子，可以直接用于项目中，或者进行微调再训练。