pyBigWig
一个用C语言编写的python扩展,用于快速访问bigBed文件以及对bigWig文件的访问和创建。 该扩展使用进行本地和远程文件访问。
目录
有关统计数据和缩放级别的注释
检索范围内单个碱基的值
检索范围内的所有间隔
检索bigBed条目
将标题添加到bigWig文件
将条目添加到bigWig文件
关闭bigWig或bigBed文件
脾气暴躁的
远程文件访问
空文件
关于坐标的说明
星系
安装
您可以使用以下命令直接从github安装此扩展程序:
pip install pyBigWig
或与conda
conda install pybigwig -c conda-forge -c bioconda
要求
必须安装以下非python要求:
libcurl(和curl-config配置)
zlib
这些文件的标头和库是必需的。
用法
基本用法如下:
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