预算matlab代码人海马沿其纵轴的自动分割。
创建该代码是为了自动分割MRI海马T1-w图像。
通过手动或使用社区中可用的工具(例如Freesurfer(已测试)或FSL)从大脑分割海马图像。
我们正在升级代码,如果有快速要求,请通过以下方式与我联系:
加里科兹·莱尔玛·乌萨比加加(Garikoitz
Lerma-Usabiaga):
尽管该工具开发的主要重点是海马,但它可以应用于任何C形细长结构,例如call体。
该代码已用于生成以下论文中的所有数据(如果使用此工具,请引用为):
G.
Lerma-Usabiaga,Iglesias,JE,Insausti,R.,Greve,D。和Paz-Alonso。
下午(2016)。
人海马沿其纵轴的自动分割。
人脑映射。
要求和安装:
git克隆此存储库(或下载.zip文件)并将其添加到您的matlab路径中。
将$
FREESURFER_HOME
/
matlab添加到您的路径
下载geom3d()并将其添加到您的路径。
在默认版本中,此软件要求您具有“优化工具箱”。
如果没有,您可以免费安装L-BFGS-B(),并在设置中更改选项。
如
2024-04-11 21:35:42
52KB
系统开源
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