Coot is for macromolecular model building, model completion and validation, particularly suitable for protein modelling using X-ray data. Coot displays maps and models and allows model manipulations such as idealization, real space refinement, manual rotation/translation, rigid-body fitting, ligand search, solvation, mutations, rotamers, Ramachandran plots, skeletonization, non-crystallographic symmetry and more.

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使用旋转计算两个分子的均方根偏差（RMSD） 使用.xyz或.pdb格式的两个笛卡尔坐标之间的旋转，使用Kabsch算法（1976）或四元数算法（1991）计算均方根偏差（RMSD），从而得到最小的RMSD。 有关更多信息，请阅读和。 动机 您拥有分子A和B，并想要计算两者之间的结构差异。 如果仅直接计算 ，则可能会产生太大的值，如下所示。 您需要首先使这两个分子重新居中，然后将它们彼此旋转以获得真正的最小RMSD。 这就是该脚本的作用。 没有变化 重新居中 旋转的 RMSD 2.50 RMSD 1.07 RMSD 0.25 引文 实施方式： 使用旋转计算两个分子的均方根偏差（RMSD），GitHub， ， Kabsch算法： Kabsch W.，1976年，“最佳旋转与两个向量相关联的解决方案”，《晶体学报》，A32：922-

PCL-1.8.1-AllInOne-msvc2015-win64百度网盘，正宗gitHub的资源。带pdb调试

visual studio .net c++ 无法查找或打开 PDB 文件错误的解决方法

Oracle 12C CDB、PDB常用管理命令

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vs2010中Cannot find or open the PDB file简单总结

Oracle 12C PDB 维护基础介绍

exe转pdb工具，用于崩溃转储dmp文件解析，该工具运行需安装VS2015，具体需要哪个组件没深入研究，我把VS2015装上了；使用方法详见：https://github.com/rainers/cv2pdb 或 https://blog.csdn.net/tianyuzhixina/article/details/115224241步骤5