软件名称：DBATools For PL/SQL Developer 发布版本：1.1.0 Beta 1 发布日期：2010-01-28 软件简介： PL/SQL Developer是Oracle数据库当前最流行的开发工具之一，它在ORACLE数据库开发设计方面功能强大，使用方便，但是数据库管理方面一直比较欠缺。 DBATools For PL/SQL Developer 是一款PL/SQL Developer的辅助插件，主要功能是提供许多DBA数据库管理的功能，使ORACLE工程师不仅可以使用PL/SQL Developer进行开发设计，同时也可以进行数据库管理及监控，大大提高工作效率。 软件安装说明： 本插件为绿色软件，将DBATools.dll和DBAToolsConfig.xml文件复制到PL/SQL Developer安装目录的PlugIns子目录即可。例如：PL/SQL Developer安装在C:\Program Files\PLSQL Developer目录，那将DBATools.dll和DBAToolsConfig.xml文件复制到C:\Program Files\PLSQL Developer\PlugIns目录下，然后重启PL/SQL Developer就可以使用。 注： 1.本软件只支持PL/SQL Developer7.0及以上的版本。 --------------------------------------------------------------- [2010-01-28]发布 DBATools For PL/SQL Developer 1.1.0 Beta 1版本更新说明 1.+ 对像快捷菜单增加了Oracle加密对像解密功能[仅支持Oracle10g] 2.# 优化了部份数据库监视SQL 3.* 修正了V1.0.0正式版中列表中数字列按字符排序的BUG --------------------------------------------------------------- [2009-01-22]发布 DBATools For PL/SQL Developer 1.0.0 正式版本更新说明 --------------------------------------------------------------- 功能列表： 1.表空间管理 2.初始化参数管理 3.重做日志管理 4.数据库监视 4.1.查看SGA统计信息 4.2.查看排序情况 4.3.查看日志切换情况 4.4.查看锁资源 4.11.查看库缓存命中率 4.6.查看数据缓存命中率 4.7.查看WorkArea情况 4.8.查看当前会话等待事件 4.9.查看数据库大小 4.10.查看等待事件统计信息 5.清空缓冲区 6.导出数据库表结构文档 7.快速打开TNSNAME.ORA文件 8.快速打开listener.ORA文件 9.快速打开Oracle Net Manager 10.自定义配置 10.1.语言配置，支持中英两种语言 10.2.菜单自定义配置 10.3.数据库监视SQL自定义配置 11.快捷菜单 11.1.表 11.1.1.分析表 11.1.2.取记录数 11.1.3.创建物化视图日志 11.1.4.设置并行度 11.2.视图 11.2.1.取记录数 11.3.物化视图 11.3.1.分析 11.3.2.取记录数 11.3.3.刷新 11.3.4.设置并行度 11.4.数据库链接 11.4.1.测试 11.11.列 11.11.1.分析 11.6.索引 11.6.1.分析 11.6.2.重建 11.7.表空间 11.7.1.管理 11.7.2.新增 11.7.3.编辑

java编写的词法分析器模拟自动机的运行，但是此程序只是初级版本未实现报错功能，提供一种思想。附测试用例

Usage: /home/chenlianfu/chenlianfu_scripts/parsing_blast_result.pl [options] blast.out > blast.tab 对BLAST的xml或tab格式的结果进行解析和过滤，得到更准确的BLAST结果。结果为表格形式（BLAST outfmt6），结果按query序列的ID排序，每个query序列的比对结果按得分排序。 --type default: xml 设置输入BLAST结果文件的类型。可以设置为xml或tab两种类型。 若是tab格式，则BLAST结果中没有query与subject的序列长度信息，默认设置下无法使用--subject-coverage和--query-coverage参数的覆盖率阈值对结果进行过滤。在设置--db-subject输入数据库FASTA文件后可以使用--subject-coverage参数进行过滤；在设置--db-query输入query序列FASTA文件后可以使用--query-coverage参数进行过滤。 若是xml格式，结果文件中包含query和subject长度信息，从而不需要使用--db-subject和--db-query参数输入FASTA序列文件。 --no-header 添加该参数则不输出表头。 --max-hit-num default: 20 设置允许的最大hit数量。 --evalue default: 1e-5 设置HSP的evalue阈值。 --identity default: 0.05 设置HSP的identity阈值。 --CIP default: 0.2 设置cumulative identity percentage阈值（这里依然使用了比值，单位不是%，所以其值要设置不大于1，默认值0.2表示20%阈值），对Hit进行过滤。CIP = 所有HSPs的一致位点之和 / 所有HSPs的比对长度之和。 --subject-coverage default: 0.2 设置所有HSPs对subject序列总体的覆盖率阈值。该参数阈值在文献中也被称为CALP（cumulative alignment length percentage），即 sum of all HSPs / subject length。 --db-subject 输入数据库的FASTA文件，以获取subject序列长度信息。 --query-coverage default: 0.2 设置所有HSPs对query序列总体的覆盖率阈值。该参数阈值在文献中也被称为CALP（cumulative alignment length percentage），即 sum of all HSPs / query length。 --db-query 输入query序列的FASTA文件，以获取query序列长度信息。 --percentage-of-top-bitscore default: 100 使用bitscore得分对hit进行过滤，设置输出hits的bitscore得分和最高得分相差不超过最高得分的百分数。hit若有多个HSPs，则取最高的HSP得分作为hit的得分；若数据库非常大，则推荐将设置该参数值设置为10，则能极大减少比对结果，保留最准确的结果；若数据库比较小，则推荐设置该参数值为50，或使用默认值；使用该参数来减少比对结果，优于仅使用最优比对结果。 --HSP-num default: max 若一个hit有多个HSPs，该参数设置输出得分指定数目个最高的HSPs。默认输出所有的HSPs。 --out-hit-confidence 添加该参数，则在表格结果第13、14和15列分别输出Hit的CIP、CALP_query、CALP_subject值。 --suject-annotation 若--type参数的值是xml，添加该参数可以生效，则额外增加最后一列suject annotation注释结果。

美化器 PL/SQL 比Pl/sql自带格式化功能好用，可在pl/sql美化器中导入模板后使用。

PL/SQL 各种常用工具包代码,包含： PDF文件生成工具包 Excel文件生成、 RTF文件生成、 Zip文件压缩与解压、 JSON格式文件生成与解析、 通过PLSQL调用FTP、 电子邮寄SMTP、POP工具包、 SOAP and REST web services工具包、 XML、HTTP工具包等

Oracle PL_SQL从入门到精通 pdf版本，适合初学者使用，采用扫描版本的pdf