psf的matlab代码光学
这是显微镜数据处理的小包装。
可与InControl软件包结合使用或用于数据分析。
作者:
所需包装:
matplotlib
麻木
libtim
科学的
skimage
文件夹包装说明
PR(阶段检索)
包含用于相位检索的代码。
基于Hanser等的方法。
“相检索瞳Kong函数在宽视野荧光显微镜”,J.显微镜,216,32--48,2004。
Oblique_aberration.py
:用于处理倾斜SPIM的.mat数据集的主程序。
所有检索到的瞳Kong功能都存储在字典中,并另存为.npz文件。
group_retrieval
:(某种程度上)处理选定文件夹中所有.mat文件的主程序。
返回斯特列尔比率和检索到的学生的列表。
核心算法包含在类PSF_PF中,该类必须在初始化时获取显微镜参数。
load_mat
:加载.mat文件(文件名mat_path
)并将其转换为numpy数组。
请注意,matlab和python中的3D数组的维数顺序不同,这需要在其中之一中进行转置以匹配两者。
Phase_retrieval.py
:改编自Ryan软件包中的p
2021-09-29 10:27:32
34KB
系统开源
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