Stochatto 是一个 Julia 包，旨在促进算法音乐创作的有效研究。这个名字的意思是玩文字游戏，混合术语stochastic，一个描述随机过程的数学术语，和staccato，一个表示简短和标点符号发音的音乐术语。

ThreeDeconv.jl是用Julia编写的用于荧光显微镜的 3D 反卷积软件。目前，它支持 Julia v.1.6.0，但在未来的版本中可能不会被支持。如果有兴趣，请随时进行 PR。该算法的详细信息可在我们的论文和我们的网站中找到。虽然反卷积算法与论文中描述的相同，但我们对软件进行了一些改进，同时对 Julia 和相关软件包进行了重大更新。多亏了这次更新，这个包比纸上报告的速度要快得多，并且可以在 5 秒内解卷积 256 x 256 x 57 的图像

受 Lucas Pope 的Obra Dinn和Surma 的同名博文启发的抖动/数字半色调软件包。 查看图库，了解所有当前实现的算法的概述。

该软件包提供实时多关联网络集成算法，用于使用 mashup 和 GeneMANIA 预测基因功能。 我们利用 Mashup 算法来替换 GeneMANIA 的线性回归部分，这被证明是非常高效的

提供实时多关联网络集成算法，用于使用 mashup 和 GeneMANIA 预测基因功能。 我们利用 Mashup 算法来替换 GeneMANIA 的线性回归部分，这被证明是非常高效的 背景 大多数成功的蛋白质功能预测计算方法集成了多个基因组学和蛋白质组学数据源，以推断未知蛋白质的功能。这些算法中最准确的算法运行时间长，因此不适合在大型基因组中进行实时蛋白质功能预测。结果，这些算法的预测存储在静态数据库中，很容易变得过时。因此，提出了 GeneMANIA，它与领先的方法一样准确，同时能够实时预测蛋白质功能。 用于基因功能分析的多网络拓扑的紧凑集成。Cho，Hyunghoon 等人。细胞系统，第 3 卷，第 6 期，540 - 548.e5

运动规划 包含机器人运动规划的算法和模型实验。该代码非常具有原型水准 接触隐式轨迹优化示例 绘画 简单的操作 网络漂移 赛博跳跃 角落里的盒子 料斗 (2D) 垂直步态 料斗 (2D) 翻转 简单的步行者（2D）（添加模型） 料斗 (3D) 料斗 (3D) 墙壁缩放 迷你高尔夫（修复 RBD 部门） 杯中球机器人手臂（从旧脚本移过来） 球杯四旋翼（从旧脚本移过来） 两足动物 (2D) 四足（2D）（修改模型） 四足（2D）在盒子上 四足（2D）后空翻 四足（3D） 蚂蚁（3D） 蛇 (3D) 地图集 直接策略优化示例 绘画 我们提供了使用 Deterministic Sampling and Collocation的Direct Policy Optimization 的示例。优化策略需要SNOPT并且其安装资源可在此处获得。这些示例中的轨迹和策略已保存并可加载以运行策略模拟和可视化。 线性二维码 双积分器 平面四旋翼 运动规划 摆 自动驾驶汽车 推车杆 火箭 四旋翼 两足动物 接触隐式模型预测控制示例 绘画

用于非平滑优化算法的 Julia 包。 这个包提供了用于最小化目标函数的算法，其中包括非平滑项，例如约束或不可微的惩罚。实现的算法包括： （快速）近端梯度法 道格拉斯-拉奇福德分裂 三项拆分 原始对偶分裂算法 牛顿型方法

这个包提供了Deepmind 的 AlphaZero 算法的通用、简单和快速的实现： 核心算法只有 2000 行纯的、可破解的 Julia 代码。 通用界面可以轻松添加对新游戏或新学习框架的支持。 这种实现比用 Python 编写的竞争替代方案快一到两个数量级，可以在带有 GPU 的标准台式计算机上解决非平凡的游戏。 可以像在单台计算机上一样轻松地在一组机器上训练相同的代理 ，而无需修改一行代码。 我为什么要关心 AlphaZero？ 除了广为人知的在国际象棋和围棋等游戏中达到超人水平的成功之外，DeepMind 的 AlphaZero 算法还展示了一种更通用的方法，将学习和搜索相结合，以有效地探索大型组合空间。我们相信这种方法可以在许多不同的研究领域有令人兴奋的应用。 我为什么要关心这个实现？ 由于 AlphaZero 需要大量资源，因此成功的开源实现（例如Leela Zero）是用低级语言（例如 C++）编写的，并针对高度分布式计算环境进行了优化。这使得学生、研究人员和黑客很难接触到它们。 该项目的动机是提供 AlphaZero 的实现，该实现足够简单，可以广泛访问，同时也

扫描角干涉显微镜 (SAIM) 拟合算法的 Julia 实现 描述 拟合算法从一堆扫描角干涉图像中重建样本高度。有关拟合算法的更多详细信息，请参见以下论文： Colville MJ、Park S、Zipfel WR 和 Paszek MJ。具有开源硬件控制平台的光学显微镜中的高速设备同步。科学报告。9：1-13。 Paszek MJ、Dufort C、Rubashkin MG、Davidson MW、Thorn KS、Liphardt JT 和 Weaver VM。2012. 扫描角干涉显微镜揭示了纳米尺度的细胞动力学。自然方法 9：825-7

使用定向蠕虫算法对相互作用二聚体模型进行蒙特卡罗采样_在 Julia 中实现_julia_代码_下载