matlab导入excel代码parWholeCell
开发并行化全细胞模型模拟器的项目。
目前,使用面向对象的MATLAB实现了简化的全细胞模型。
截至2013年3月12日,该代码实现了一个简单的包含7个子模型的全单元模型。
子模型非常简单。
络合
代谢:流量平衡分析
RNA降解
RNA成熟:加工,裂解等
蛋白质成熟:成熟,易位
转录
翻译
和3个州:
分子计数:代谢产物,RNA,蛋白质单体,复合物。
每种RNA和蛋白质都有两种形式:新生和成熟。
代谢:生长和React通量
大量的
该模型包括3个隔层:
胞质溶胶
膜
细胞外空间
要求
MATLAB>
=
R2012b
MATLAB工具箱生物信息学
安装
从github仓库克隆
ssh://git@github.com:CovertLab
/
parWholeCell.git
打开MATLAB,转到parWholeCell目录
此外,在每个MATLAB会话开始时设置MATLAB警告和路径setWarnings();
setPath();
就是这样!
如何进行模拟和绘图
使用下面的代码使用默认选项和参数值运行仿真。
%
set
warn
2022-01-19 12:14:26
2.4MB
系统开源
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