混沌映射sin映射初始化种群,与标准pso求解sphere函数,精度更好
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Poppr版本2 什么是poppr ? Poppr是一个R软件包,用于分析具有性和克隆繁殖混合模式的人群。 它围绕genind和genlight对象的框架构建,并提供以下实现: 在层次结构的多个级别中的任何一个级别上对人口进行克隆检查 方便的多基因座基因型计数和具有多个层次结构的种群子集 定义多基因座基因型 基因型多样性,均匀性,丰富性和稀疏性指标的计算 引导距离支持遗传距离的树状图的绘制 遗传距离的最小跨度网络图 关联指数的计算( ) 或者 ( ) 已安装R(≥2.15.1)的任何服务器上的批处理 微卫星(SSR)标记的Bruvo距离的计算(以C表示为速度) 从导入数据并导出到 2.0版的新功能: 基因组SNP数据处理 自定义多基因座基因型定义 通过遗传距离折叠多基因座谱系 计算网状最小跨度网络 计算跨snps的滑动窗口中的关联索引 MLG多样性统计的自举 和更多! 有关完整
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双感应遗传matlab代码遗传算法 什么是遗传算法 “遗传算法 (GA) 是一种基于模拟生物进化的自然选择过程来解决有约束和无约束优化问题的方法。” 描述 遗传算法 (GA) 与 Matlab 在您的计算机上运行代码,并在 MatLab 环境中运行。 文件清单 -> 寻找最佳点的功能。 -> 此函数可帮助您将二进制字符串转换为双变量( numbConv 的反函数)以进行交叉和其他操作。 -> 这是用于为函数的每个值分配权重的成本函数计算器。 -> 程序的主要方法。 当您准备好克隆存储库时运行此文件。 -> 将双变量转换为二进制值对应的位数会在过程中考虑。 规格和变量 pop -> 保存当前人口的变量。 x -> 考虑自变量的范围。 J -> 成本函数(Jx)值 numOfPop -> 算法考虑的人口数量。 您可以更改并查看操作中发生了什么(但它会消耗您的资源) min_variance -> 作为迭代终止的总体的最小方差。 通过减少这一点,您可以获得准确的最佳点,并且可能需要更多的迭代才能收敛。
2022-01-17 21:29:40 29KB 系统开源
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种群的保护是保护生物学中一个重要的问题, 基本上 所有濒危的动植物都是小种群。因为小种群种群数量小, 其自身数量变化的统计学随机性较大, 而且更容易受到环境 波动、灾害、遗传漂变和近交衰退的影响, 所以更加容易灭 绝。目前, 种群生存力分析( Popu lation V iab ility Analysis, 简 称PVA)在小种群的保护上已经形成了一套比较完备的理论 和方法。其中, VORTEX模拟模型是目前应用最广泛的PVA 模型之一, 已应用于几十个物种的PVA。20世纪90年代以 来, 中国学者运用该模型对一些珍稀濒危物种进行了模拟, 得到了一些对物种保护有重要意义的研究成果。
2022-01-13 07:17:53 216KB 种群 论文
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马知恩 种群生态学的数学建模 种群生态学的数学建模与研究, 1996.1.1, 1, 精, 平, 大32, 30, 马知恩, 严云锦, 第十八届华东地区优秀教育图书奖二等奖, 华东地区优秀教育图书评奖委员会
2022-01-13 07:03:59 4.64MB 马知恩 种群生态学 数学 建模
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传统的遗传算法求解VRP时,初始种群多半采取随机生成法形成染色体方案,以致于迭代开始就可能形成许多不可行的方案,要进行大量的计算后才能得到优化的方案,这在很大程度上降低了算法的运算效率。论文提出的遗传编码策略,对初始种群给予基于知识型启发策略,使得初始种群一开始就表现为一种较优的状态。
2022-01-06 16:05:28 346KB 工程技术 论文
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遗传算法matlab初始化代码与论文相关的代码: 一般微分赫布学习:捕捉神经网络和大脑中事件之间的时间关系 作者:Stefano Zappacosta、Francesco Mannella、Marco Mirolli、Gianluca Baldassarre 文件树的描述 “launch.sh”是主脚本。 它管理整个遗传算法的执行和分析的各个阶段 o-* code/script/launch.sh | | o--* code/matlab/ga_analysis.r (1) # Matlab script executing the genetic algorithm | o--* code/matlab/ga_test_par.r (2) # Matlab script testing the genetic algorithm | o--* code/matlab/bayesian_information_criterion.r (3) # Matlab script testing the genetic algorithm | o--* code/matlab/ga_test_
2021-12-14 20:59:09 73KB 系统开源
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41种群的特征.ppt
2021-12-13 22:01:37 2.04MB
针对差分进化算法易出现早熟现象和收敛速度慢等问题, 提出一种具有人工蜂群搜索策略的差分进化算 法. 利用人工蜂群搜索策略很强的探索能力, 对种群进行引导以帮助算法快速跳出局部最优点. 此外, 为了提高算法 的全局收敛速度, 采用一种基于反学习的初始化方法. 通过对12 个标准测试函数进行仿真实验并与其他算法相比较, 表明了所提出的算法具有较快的收敛速度和很强的跳出局部最优的能力.
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SMC ++是一个用于从整个基因组序列数据估算种群大小历史的程序。 内容 遇到麻烦该怎么办 档案格式 输入数据格式 输出数据格式 快速入门指南 请遵循安装说明。 使用vcf2smc将您的VCF转换为SMC ++输入格式: $ smc++ vcf2smc my.data.vcf.gz out/chr1.smc.gz chr1 Pop1:S1,S2 此命令将解析样本S1和S2的重叠群chr1数据,样本S1和S2是总体Pop1成员。 您应该为数据集中的每个独立重叠群运行一次,从而为每个重叠群生成一个SMC ++输出文件。 使用估计值拟合模型: $ smc++ estimate -o analysis/ 1.25e-8 out/example.chr*.smc.gz 第一个强制性参数1.25e-8是每代的突变率。 其余参数是在上一步中生成的数据文件。 根据样本量和您的机器,安装过程应在
2021-12-08 16:29:55 2.33MB C++
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