BeeDeeM :生物信息学数据库管理系统
BeeDeeM是一个通用的乙ioinformatics d atabank中号anager。
它提供了一套命令行和UI软件,用于安装和使用主要序列数据库和生物学分类。 它是的理想伴侣。
主要特点
BeeDeeM自动执行:
从远程站点下载数据库文件(通过FTP,Aspera),
解压缩文件(gzip文件),
解压缩文件(tar文件),
本地序列库(例如Genbank)到FASTA文件的转换,
从本地序列库格式以BLAST格式准备数据库,
对Genbank,Refseq,Embl,Genpept,Swissprot,TrEmbl,Fasta,Silva和BOLD文件建立索引,从而可以通过序列标识符进行高效查询,
序列特征和本体数据(NCBI分类法,基因本体论,酶委员会和Intepro域)的索引,
从带注释的序列库中准备分类学子集,
2022-04-12 13:36:18
231.37MB
Java
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