主要介绍了Pthon批量处理将pdb文件生成dssp文件,通过本例主要学习遍历目录下文件的方法,需要的朋友可以参考下
2021-11-26 16:58:36
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这是我所知道的在 PDB 中读取的最快方式。 字符串可以方便地存储为单元格变量，而数字存储为矩阵。 不幸的是，我知道没有更快的方法将文本转换为数字，因此在 matlab 中读取 PDB 有一个上限。
为了加速程序，注释掉所有未使用数据的行。 注释转换数字数据的一行可将程序速度提高大约 7-8%。
示例用法：这绘制了 3IJU.pdb 的原子
原子= fastPDBRead（'3IJU.pdb'） plot3(atoms.X, atom.Y, atom.Z, '.');
2021-11-26 16:57:06
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Prodar是一个搜索应用程序，可查询PDB以获取候选结构比对。 搜索的输入是从标准（文本）PDB文件中读取的蛋白质骨架结构，返回的结果仅基于骨架的结构相似性，而与序列信息无关。 搜索速度非常快，通常不到一分钟即可搜索到PDB（包含在应用程序中）。 Prodar会识别部分匹配项，因此无论链的相对大小如何，查询结构的较小部分都可以与PDB中其他结构的部分进行匹配。 目的是使该工具自动识别原本不同的蛋白质结构中的共同结构域和基序。 然后可以使用其他工具在结构上对齐这些文件，以找到RMSD（Prodar会提出建议）。 Prodar鼓励采用互动式的发现方式，在此方式中搜索会Swift完善并重新运行。 结果可能令人惊讶！
2021-11-22 22:29:07
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和PCL-1.8.1-AllInOne-msvc2015-win64.exe 软件一起配套使用 之前我也上传了 千万要注意 你的VS型号 千万要对应好
2021-11-15 13:46:54
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Oracle 12C推出了一个新特性，多租户（Multitenant）,这是甲骨文向云计算或者云数据库迈出的一大步。CDB与PDB是Oracle 12C引入的新特性，本套课程将详细讲述如何使用容器数据库。
2021-11-11 14:27:20
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PyPDB
使用RCSB蛋白质数据库（PDB）执行搜索的Python 3工具箱。 这可用于对符合各种条件的PDB ID执行高级搜索，以及查找与特定PDB ID相关的信息。 该工具允许在Python脚本中执行可以在PDB网站中执行的标准操作（BLAST，PFAM查找等）。
每个函数及其相关输出的示例可以在找到。
如果您将此模块用于任何已发表的作品，请考虑引用随附的论文
Gilpin, W. "PyPDB: A Python API for the Protein Data Bank."
Bioinformatics, Oxford Journals, 2015.
截至2020年11月，为了适应RCSB PDB API的更改并扩展功能，pypdb正在进行大量重构。 对于此过程中发生的任何重大变化，我们深表歉意。 pypdb的先前版本可； 但是，它将不再对更改的RCSB API起
2021-11-09 11:35:45
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PCL 1.10.1安装包以及资源文件，因为github下载速度很慢，所以这里做一个分享，之前下载别人分享的资源，发现里面是源码
2021-11-03 15:39:33
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