PyPDB 使用RCSB蛋白质数据库(PDB)执行搜索的Python 3工具箱。 这可用于对符合各种条件的PDB ID执行高级搜索,以及查找与特定PDB ID相关的信息。 该工具允许在Python脚本中执行可以在PDB网站中执行的标准操作(BLAST,PFAM查找等)。 每个函数及其相关输出的示例可以在找到。 如果您将此模块用于任何已发表的作品,请考虑引用随附的论文 Gilpin, W. "PyPDB: A Python API for the Protein Data Bank." Bioinformatics, Oxford Journals, 2015. 截至2020年11月,为了适应RCSB PDB API的更改并扩展功能,pypdb正在进行大量重构。 对于此过程中发生的任何重大变化,我们深表歉意。 pypdb的先前版本可; 但是,它将不再对更改的RCSB API起
2021-11-09 11:35:45 49KB proteins pdb protein-data-bank protein-structure
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Windows下MinGW生成pdb文件的工具。便于WinDbg分析崩溃时候的dmp文件。
2021-11-04 09:20:56 365KB MinGW pdb
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PCL 1.10.1安装包以及资源文件,因为github下载速度很慢,所以这里做一个分享,之前下载别人分享的资源,发现里面是源码
2021-11-03 15:39:33 391.71MB PCL PCL1.10.1
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数据库信息 查看PE文件的pdb信息的简单工具。
2021-10-19 10:45:29 2.24MB C++
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该款软件可以把PDB内容提取生成Text文档。
2021-10-13 10:28:00 269KB PDB Text TxT 文本文件
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可以将从protein data bank 下载的pdb文件批量转换为 txt格式的,保存到指定文件夹中。
2021-10-13 10:23:38 7KB pdb txt 批量转换
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蛋白质-配体相互作用分析仪(PLIP) 轻松分析3D结构中的非共价蛋白-配体相互作用。 用例 码头工人 奇点 Python模块 “我想分析我的蛋白质-配体复合物!” :check_mark: :check_mark: :yellow_circle: :cross_mark: “我想分析十亿个蛋白质-配体复合物!” :cross_mark: :yellow_circle: :check_mark: :yellow_circle: “我喜欢Linux命令行,并希望围绕PLIP构建工作流程!” :cross_mark: :check_mark: :check_mark: :yellow_circle: “我是一名Python程序员,想在我的项目中使用PLIP!” :cross_mark: :yellow_circle: :yellow_circle: :check_mark: 快速开始 码头工人 如果已安装Docker,则可以使用以下shell命令对结构1vsn运行PLIP分析: 在Linux / MacOS上:
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PDB符号文件查看工具, 包含2个工具symview 和pdbxtract symview可查看文件所有原始信息 pdbxtract 可方便查看结构体等信息, 可导出头文件或xml
2021-10-03 23:14:37 4.55MB pdbxtract symview DPB
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最权威的蛋白数据库,最权威的PDB使用指南
2021-10-03 15:21:48 5.45MB PDB
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虚假数据库 从IDA Pro数据库生成PDB的工具 支持IDA> = 7.0 怎么获得 从发布页面下载最新版本: : 或从源代码编译: 运行/build.ps1 从/~build/deploy fakepdb.zip /~build/deploy获取fakepdb.zip 如何安装 将fakepdb.zip内容复制到/plugins 如何使用 此插件有几个功能: 1. PDB文件生成 在IDA> = 7.0中打开目标可执行文件 Edit -> FakePDB > Generate .PDB file (或Ctrl + Shift + 4 ) 从IDA数据库目录获取PDB文件 PDB可以选择包含功能标签的符号:使用Generate .PDB file (with function labels) (或Ctrl + Shift + 5 )。 2. IDA数据库导出到.json 在IDA> = 7.0中打开目标可执行文件 Edit -> FakeP
2021-09-24 13:17:17 379KB debugging cpp pdb llvm
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