gff2gtf
用于将 GFF 文件转换为 GTF 的 AWK 脚本。
用法:
awk -f gff2gtf.awk 文件.gff > 文件.gtf
适用于那些具有 AWK 解释器的操作系统。 该脚本依赖于记录的顺序。 规范不要求对 GFF 进行排序,但通常对记录进行排序。
对于 RSEM:
awk -f gff2gtf-strict.awk FILE.gff > FILE.gtf grep -Ev "\sgene\s" FILE.gtf > rsem-ready.gtf
标签: NGS,下一代测序,遗传学,fasta,DNA,RNA,比对,基因组标记。
2022-03-10 20:53:39
9KB
Awk
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