Denoiser:用于fMRI BOLD数据的令人讨厌的回归工具
Denoiser是一种用于从功能性MRI数据中去除噪声源并对其进行时间滤波的工具。 它还提供了有害信号内容的可视化(包括运动信息,如果提供的话),使用户可以快速了解噪声消除前后的数据质量。
去噪器作用于4D fMRI数据(采用nifti文件路径或已加载的nibabel对象作为输入)。 在体素水平上执行有害信号去除和时间滤波,并创建一个“清理过的” 4D Nifti文件( _NR文件)/ nibabel对象作为输出。
由用户指定要消除的特定噪声信号(包含在tsv文件中)。 仅在对BOLD数据进行最少的预处理之后(例如,在使用fmriprep预处理数据fmriprep ,该工具会创建一个包含滋扰信号的.tsv文件),才应使用此工具。 有关如何运行的说明,请输入:python run_denoise.py -h
用法:ru
2023-05-10 00:20:11
16KB
Python
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