细胞色素c与单壁碳纳米管相互作用的分子动力学模拟研究,刘海俐,谭朋利,本文采用分子动力学(MD)模拟研究了pH对细胞色素c,以及不同pH条件下,单壁碳纳米管对细胞色素c结构的影响。 本文研究发现酸性条件对
2021-09-05 20:42:48 827KB 首发论文
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介绍分子动力学的基本概念和应用,可以帮助解决初学者对概念的理解
2021-08-25 22:17:20 293KB 分子动力学 概念介绍
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基于云计算的糖尿病受体与药物的分子动力学模拟.pdf
2021-07-17 11:03:11 1.14MB 云计算 行业数据 数据分析 参考文献
分子动力学模拟的理论与实践.pdf
2021-07-16 09:04:48 110.98MB 行业
基于python的分子动力学模拟程序编写及应用.pdf
2021-06-28 20:04:04 2.12MB Python 程序 软件开发 论文期刊
DL_POLY分子动力学模拟软件包
2021-05-13 13:00:33 2.64MB Linux DL_POLY 分子动力学模拟
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AMBER分子动力学模拟软件(AMBER18, AMBER19) AMBER是著名的老牌开源分子动力学模拟软件,最新版本是AMBER19(但是19版本的并行模拟模块还没公布,只有AmberTools19)如果需要并行计算可以下载编译18版本 由于AMBER国外网站下载非常不稳定,经常掉线,并且每次掉线以后又需要重头下载,非常折腾人,故分享此百度云盘链接给需要的同学们。
2021-04-21 10:22:02 119B AMBER AmberTools 分子动力学 分子模拟
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EN.553.738高维近似,概率和统计学习最终项目 关查理,胡志明,张杰@约翰·霍普金斯大学 在这个项目中,我们探索三种不同的非线性降维/流形学习算法:Isomap,局部线性嵌入(LLE)和扩散图/ Laplacian特征图。 我们在数据集上对这些算法进行基准测试,例如经典的瑞士卷,虹膜,MNIST和神经元尖峰数据。 我们还将它们与主成分分析(PCA)进行比较,后者是一种线性降维算法。 最后,我们有一个使用扩散图的演示来分析氢二聚体的玩具分子动力学模拟的自由能态。 要运行任何基准测试/演示,请启动相应的脚本: python filename.py 。 您可以编辑每个脚本中每个算法中的超参数,例如投影维和相邻算法的数量。 先决条件 脚本要求: 数据集 Swiss Roll和Iris数据集是从sklearn.datasets包生成的。 我们下载了亚·莱卡的网页的数据库MNIST。 神经
2021-04-02 16:39:36 13.34MB Python
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分子动力学模拟lammps 粘度表面张力分析in文件分子动力学模拟lammps 粘度、表面张力分析in文件
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LAMMPS 后处理 计算应力hydro_stress和von Mises stress的脚本。
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