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FindTelomeres:用于在FASTA文件中查找端粒重复序列(TTAGGGCCCTAA)的python脚本
这个脚本做什么? 这是用于在FASTA文件中查找端粒重复序列(TTAGGG / CCCTAA)的工具。 该脚本不做什么? 它只会在序列的开头和结尾寻找端粒。 它仅查找TTAGGG / CCCTAA重复序列的变体。 它是如何做到的? 它以FASTA文件作为输入,并逐一遍历其中的序列。 在每个序列的开头和结尾,它都会忽略N(未知碱基)。 对于每个序列,它将查看前(最后)50个核苷酸,并评估端粒重复覆盖了该序列的多少。 这是故意灵活的,以允许测序错误和端粒基序的序列/长度变化。 更具体地说,如果前50个核苷酸中至少有50%被端粒重复序列覆盖,则将其称为端粒。 在大多数情况下,默认设置50%(-c /-cutoff)和50 nts(-w /-window)似乎效果很好。 一些端粒可能很短,或者与典型的TTAGGG / CCCTAA基序不同。 使用这些参数,它们很可能会被恢复。 但是,可以
2023-01-10 22:44:53
34KB
telomeres
Python
1
ARMA(p,q)的最小二乘估计-时间序列分析
ARMA(p,q)的最小二乘估计 非线性最小二乘估计
2023-01-10 15:36:12
682KB
ARIMA
时间序列
1
alignmentbd:已实现的DNA序列比对算法的集合,包括最佳全局比对,带状全局比对和用于多序列比对的近似算法
对齐方式 已实现的DNA序列比对算法的集合,包括最佳全局比对,带状全局比对和用于多个序列比对的近似算法。
2023-01-10 10:53:40
151KB
C++
1
进化算法在DNA序列比对中的应用
关于生物信息学的资料 上面是进化算法在基因序列中的应用
2023-01-10 10:50:55
170KB
生物信息学
1
distance-estimator-paper:使用双端读取估计两个核苷酸序列片段之间的距离
距离估计器 使用双端读取估计两个核苷酸序列片段之间的距离
2023-01-10 08:35:10
17KB
TeX
1
ANSI:ANSI转义序列,使用CSI控制颜色,光标位置等
ANSI转义序列 用ANSI转义序列控制您的终端。该库使用ANSI转义序列制作颜色,光标移动等。·请求功能。 目录 关于该项目 使用控制您的终端。该库使用ANSI ESCAPE SEQUENCE进行颜色和光标移动等。 该库使用模板操纵器,意味着易于使用 支持最大值 建于 该库具有ANSI转义序列,无需外部库。 入门 该库支持ANSI转义序列中的大多数功能,您可以轻松地使用它,并且该库使用操纵器来简化工作。 安装 这是仅标头的库,意味着您可以仅获取一个文件并将其包含在内。 用法 使用此库非常容易,这里是示例Hello world代码, # include < iostream> # include " ../src/srilakshmikanthanp/ANSI.hpp " using namespace srilakshmikanthanp ; int main () { st
2023-01-07 02:34:54
243KB
C++
1
Raize 6.1.10 for XE7
Raize 6.1.10 for XE7
2023-01-06 22:39:26
49.84MB
Delphi
XE7
Raize
序列号
1
Raize 6.1.10 for DelphiXE7
DelphiXE7下可用的Raize,含序列号
2023-01-06 22:35:42
56MB
Delphi
XE7
Raize
序列号
1
运用GA-BP神经网络研究时间序列的预测 (2009年)
神经网络能以任意精度逼近非线性函数,以神经网络为基础的时间序列预测模型能很好地反映信息的非线性发展趋势。该文在分析传统BP网络缺点的基础上,用具有良好全局搜索能力的遗传算法来改进神经网络。详细讨论了GA算法的优化神经网络初始权值和阈值的思想和理论。在阐述预测方法同时,用具体例证分析了GA-BP网络预测的性能和特点。结果表明,基于GA-BP神经网络在预测精度和适应性方面高于传统的BP神经网络。
2023-01-04 21:13:59
336KB
自然科学
论文
1
MATLAB实现LASSO分位数回归时间序列预测(完整源码和数据)
MATLAB实现LASSO分位数回归时间序列预测(完整源码和数据) 两个月数据,不同特征预测,预测80%间隔,不同特征选择误差,日前一天各个预测点的分位数,程序乱码是由于版本不一致导致,可以用记事本打开复制到你的文件。
2023-01-04 15:28:22
2.66MB
LASSO
分位数回归
时间序列预测
完整源码和数据
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