psf的matlab代码CLP-SECM数据的成像算法 1.概述 此代码包专用于通过由连续线探针（CLP）测量的扫描化学显微成像（SECM）数据进行图像重建。 通过将样品放在旋转台上并将线探针放置在样品的一侧来设置CLP-SECM扫描。 产生一条扫描线的方法如下：显微镜首先将其载物台旋转一个预定的角度，然后以恒定的步长将CLP逐步移动到样品的另一端。 在每个步骤中，CLP都会测量样品和探针末端之间通过电化学React产生的电流。 线扫描是在所有步骤中所有测量值的集合，其中样品旋转固定在某个给定角度。 结合在不同样品旋转角度下的信号线扫描可获得完整的CLP-SECM扫描。 在我们的实验中，感兴趣的样品-附着在基质上的化学React物种-具有高度结构化。 更具体地，形状React性物质是已知的，与样品尺寸相比要小得多，并且也稀疏地填充在基板上。 因此，可以将样本Y建模为React物种D与稀疏激活图X 0之间的2D卷积，表示为Y = D * X 0 。 我们采用压缩传感方法，通过找到精确的位置图X 0来重建SECM样本图像。 定义CLP线扫描L取样本Y和CLP属性p ---扫描角，CLP的点

psf的matlab代码MSBL Matlab实现的M-SBL算法。 可以找到以下文件： MSBL：M-SBL算法的实现（请参阅参考资料）。 createDicMat：函数，用于基于PSF创建字典矩阵H。 演示：用例示例。 我们要感谢张志林博士，他提供了M-SBL代码的基础。

psf的matlab代码内容 实用的组织，评估 主要目标 探索用于科学计算的高级语言的可能性，在本例中为Python，具有模块Numpy，Scipy，Matplotlib等。 通过练习发现PDE的近似值。 到达那里的方法 面对面和远程地在协作小组中工作：通过项目和池会议进行学习。 每组3至4名学生负责一个项目。 该项目在TP小时内免费进行。 每个项目都会引起 每周进度报告； 在几届会议后进行讨论的时间； 产生最终报告； 在所有学生面前的演讲。 评估 第一场：0.7 *报告+ 0.3 *持续评估（演示+每周crs） 会话2：0.7 *报告的第二版+ 0.3 *最大值（对会话1的持续监控，报告得分为会话2），即最大规则 排程CM的8小时+ TDM的16小时 厘米 时分复用 3小时 星期二11/09/2018 9:30 12:30 A28 / CREMI / 105 git，python简介 2小时40 2018年9月18日星期二 9：30-10：50 a.m.，11 a.m.-12:20 p.m. A28 / CREMI / 105 个体TP1 2小时40 星期二02/10/2018 9：

psf的matlab代码PSF模型-py 点扩散函数的标量和矢量模型的Python绑定。 原始C ++代码和MATLAB MEX绑定版权所有:copyright:2006-2013，根据GPL-3.0许可分发。 Talley Lambert的Python绑定 该模型在Auget等人2009 1中进行了描述。 有关更多信息和实现细节，请参见Francois的论文2 。 1个 2个 也可以看看： 有关基于标量的Gibson-Lanni PSF模型的不同（更快）的信息，请参见项目，该项目已在，和中实现。 安装 在OS X和Windows的pypi上可用的预构建二进制文件，在Linux上的sdist可用 pip install psfmodels 从来源 （需要cmake和C ++编译器） git clone --recurse-submodules https://github.com/tlambert03/PSFmodels-py.git cd PSFmodels-py python setup.py install # or python setup.py build to just build but n

psf的matlab代码概括： •PET数据的分析模拟（有无噪声） •从您自己的图像开始，或者您可以使用我们随附的NEMA NU-2幻像生成器 •启用嘈杂且无噪音的重建。 •使用2D有序子集期望最大化（OS-EM）算法的统计PET图像重建框架 •分别结合使用CT正弦图和检测器归一化图进行衰减和归一化建模与校正。 •集成的广义PSF建模（分辨率建模），可对重建中的真实PSF，no-PSF以及低估和高估的PSF进行建模 •可以改变一系列数据采集和图像重建参数 •能够模拟和重建不存在信号（肿瘤）的功能，即用背景和存在的信号替换信号值，以研究模型参数在与肿瘤完全相同的背景下对背景的影响。 参考： 如果发布使用此软件工具获得的结果，请使用以下参考： S. Ashrafinia等人，“用于优化定量任务性能的通用PSF建模”，物理。 中生物化学，第1卷。 62，第5149-5179页，2017年。 技术说明： 基于Matlab:registered:的框架结合了PET正向投影和重建步骤。 该框架对许多现实的PET重建过程进行了建模，例如放射性衰变，使用CT正弦图执行衰减校正以及使用归一化正弦图进行检测器灵敏度归一化的能力

psf的matlab代码物理光学 用于物理光学仿真的软件包。 物理光学比射线光学更通用，但不如完整的电动力学通用。 由于此软件包尚处于开发的早期阶段，我们将很高兴欢迎任何新的贡献者！ 文献资料 建置状态 代码覆盖率 安装 目前尚未注册，正在开发中。 但是主分支可以安装： julia > ] add https : // github . com / JuliaPhysics / PhysicalOptics . jl 特征 实施的 快速卷积适应物理光学的需求。 像conv_psf和conv_otf类的方法是更通用的conv和conv_v_ft包装器。 菲涅耳和瑞利-索默费尔德的光传播（ propagate ） 2D锌PSF 一些转换方法 菲涅耳光的传播 光学元件，例如镜头，光圈 一些光学转换 微透镜 Fraunhofer的光传播 具有Debye积分的聚焦和散焦PSF（3D）。 通缉 通过ChainRulesCore注册卷积的伴随 更多测试 方法参数的清理 文献资料 文学 作为资源，我们建议 古德曼，约瑟夫·W。傅立叶光学入门， 杰罗姆·默兹（Mertz，Jerome）。 光学显微镜简介

psf的matlab代码光学 这是显微镜数据处理的小包装。 可与InControl软件包结合使用或用于数据分析。 作者： 所需包装： matplotlib 麻木 libtim 科学的 skimage 文件夹包装说明 PR（阶段检索） 包含用于相位检索的代码。 基于Hanser等的方法。 “相检索瞳Kong函数在宽视野荧光显微镜”，J.显微镜，216，32--48，2004。 Oblique_aberration.py ：用于处理倾斜SPIM的.mat数据集的主程序。 所有检索到的瞳Kong功能都存储在字典中，并另存为.npz文件。 group_retrieval ：（某种程度上）处理选定文件夹中所有.mat文件的主程序。 返回斯特列尔比率和检索到的学生的列表。 核心算法包含在类PSF_PF中，该类必须在初始化时获取显微镜参数。 load_mat ：加载.mat文件（文件名mat_path ）并将其转换为numpy数组。 请注意，matlab和python中的3D数组的维数顺序不同，这需要在其中之一中进行转置以匹配两者。 Phase_retrieval.py ：改编自Ryan软件包中的p

psf的matlab代码| | 高分辨率傅里叶光场显微镜用于体积多色活细胞成像 HRFLFM数据处理 该软件包包括数据预处理，图像背景减法，ACsN去噪算法和HR-FLFM 3D重建代码。 先决条件包括具有足够GPU内存的Nvidia GPU，Matlab 2020或更高版本，具有足够CPU内存的多核CPU。 使用DataProc4HRFLFM.mlapp文件可以有一个好的开始！ PSF校正 该软件包包括生成用于3D重建的混合FLFM PSF的方法。 使用该程序之前，请确保准备好模拟的PSF和实验性PSF。 播放参数，以确保它最适合您的显微镜系统。 使用PSFCorrManual.mlapp文件有一个好的开始！ 网络 请参考->

psf的matlab代码py 用于点扩散函数建模和有限元分析的Optomechanics python库 OMpy是用于光机械分析的python库。 特别是它被编写成接受机械数据（测量或模拟数据或有限元分析结果）并获取可用于将这些数据输入到Zemax光学分析软件中的参数（刚体运动，光学表面变形）。 为此，它具有完成光机械分析中一些常见任务的功能： 根据光学Kong径上的波前误差图模拟点扩展函数（PSF） 根据光学表面的垂度位移产生波前误差图 通过有限元分析（FEA）模拟计算下垂位移 计算对象的刚体运动（平移+旋转）（测量数据或FEA结果） 使用Zernike条纹多项式拟合表面或波前误差图 灵感 这种类型的分析非常普遍，但经常被价格昂贵的软件所控制。 大多数光力学软件背后的数学运算已有广泛的文献记载，而大多数商业软件包的优势在于能够轻松地与大量可用的光学元件和FEA代码进行交互。 我的目标不是编写商业质量的程序包，而是编写一些可以适应不同常见任务的有用脚本。 OMpy的许多功能都是根据Sigmadyne（）的SigFit建模的，该公司拥有大量描述其拟合算法方法的文档和白皮书。 针对相同F

psf的matlab代码光场反卷积 标题：“用于光场显微镜的相空间反卷积”的Matlab代码本书作者：陆志（），吴佳敏，乔慧和游洲.etc 版本：1.0版权：2019，陆志，吴佳敏，乔乔，游洲，陶岩，周紫荆，张旭，范静涛，戴琼海*根据参考文献[1]编辑。 Matlab代码，“用于光场显微镜的相空间反卷积” 该软件包包含了本文中描述的相空间反卷积算法的实现：陆志，吴家敏，乔巧和尤周等，“用于光场显微镜的相空间反卷积”。 如果使用该代码在学术出版物中生成数据（例如，图像，处理时间表等），请引用我们的论文。 有关算法的详细信息，请参阅我们的论文。 如何使用 该代码在具有Microsoft Xeon和32GB RAM的MS Windows 10 64位版本下的MATLAB 2018b（64bit）中进行了测试。 打开包装 在您的Matlab路径中包含代码/子目录 运行“ main.m”以尝试包含在此软件包中的示例。 通过“” a）下载所需的数据。 本文中参考图3的光场数据（B16cell的成像）保存在“ Raw”中，可用于测试。 b）。 点扩展功能的MAT文件位于目录“ PSF”中。 读者还可