PDBExplorer是一款能够帮助用户查询.pdb为后缀的文件中内容的软件，通过PDBExplorer用户能够对某个.pdb文件进行快速的关键词检索，软件能够查询到文件中的符号名称和所有的地址信息，是

c++ 开发人员创建的工程文件夹下有很多占用大量空间的文件，该工具可以选择目录，并删除目录下面所有的大文件，减小存储和传输压力。 若 debug 或 release 下面有dll文件，可能为重要外部文件，则不删除

pdb蛋白质数据库中pdb文件格式介绍，把网站上的帮助文档做成了chm的电子书形式，方便观看。

PCL安装所需文档，PCL-1.8.0-AllInOne-msvc2013-win64-pdb

zProt 用于读取和处理蛋白质数据库（pdb）文件的库

2个dll扩展文件：FiddlerExtensions.dll及FiddlerExtensions.pdb（这2个文件是为了扩展Fiddler的导出功能，支持导出JMeter使用的.jmx格式文件），拷贝至Fiddler\ImportExport目录下

这两个程序都使用数据结构来存储有关 PDB 的信息。 我发现这些程序对于处理PDB和可视化3D点信息都是有用的 -- 用法示例：绘制 3IJU.pdb 的原子 -- PDBdata = pdb2mat('3IJU.pdb'); % 从 PDB 文件读入数据plot3(PDBdata.X, PDBdata.Y, PDBdata.Z, '.'); % 绘制数据的 3D 图-- 用法示例：将 3IJU.pdb 的原子沿 x 方向平移 10 埃 -- PDBdata = pdb2mat('3IJU.pdb'); % 从 PDB 文件读入数据PDBdata.X = PDBdata.X + 10; % 平移坐标PDBdata.outfile = '3IJU_tran10angXdir.pdb'; % 更新文件名mat2pdb(PDBdata); % 以 PDB 格式输出数据 -- 示例用法：在一个

主要介绍了Pthon批量处理将pdb文件生成dssp文件,通过本例主要学习遍历目录下文件的方法,需要的朋友可以参考下

这是我所知道的在 PDB 中读取的最快方式。 字符串可以方便地存储为单元格变量，而数字存储为矩阵。 不幸的是，我知道没有更快的方法将文本转换为数字，因此在 matlab 中读取 PDB 有一个上限。 为了加速程序，注释掉所有未使用数据的行。 注释转换数字数据的一行可将程序速度提高大约 7-8%。 示例用法：这绘制了 3IJU.pdb 的原子 原子= fastPDBRead（'3IJU.pdb'） plot3(atoms.X, atom.Y, atom.Z, '.');

Prodar是一个搜索应用程序，可查询PDB以获取候选结构比对。 搜索的输入是从标准（文本）PDB文件中读取的蛋白质骨架结构，返回的结果仅基于骨架的结构相似性，而与序列信息无关。 搜索速度非常快，通常不到一分钟即可搜索到PDB（包含在应用程序中）。 Prodar会识别部分匹配项，因此无论链的相对大小如何，查询结构的较小部分都可以与PDB中其他结构的部分进行匹配。 目的是使该工具自动识别原本不同的蛋白质结构中的共同结构域和基序。 然后可以使用其他工具在结构上对齐这些文件，以找到RMSD（Prodar会提出建议）。 Prodar鼓励采用互动式的发现方式，在此方式中搜索会Swift完善并重新运行。 结果可能令人惊讶！