脑提取器
FSL的Python脑提取工具的重新实现。
遵循以下算法:
Smith SM. Fast robust automated brain extraction. Hum Brain Mapp.
2002 Nov;17(3):143-55. doi: 10.1002/hbm.10062. PMID: 12391568; PMCID: PMC6871816.
安装
要安装,只需使用pip安装此仓库:
# install repo with pip
pip install git+https://github.com/vanandrew/brainextractor@main
# install from local copy
pip install /path/to/local/repo
需要注意的是reccomended使用brainextractor Python的3.7+
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