模数流
Nextflow管道，用于从NCBI SRA下载和处理微生物RNA序列数据
设置
安装
检查的Java 8或更高版本安装使用： java -version
将nextflow下载到当前目录： curl -s https://get.nextflow.io | bash curl -s https://get.nextflow.io | bash
通过运行以下./nextflow run hello测试安装： ./nextflow run hello
安装
为您的数据集准备元数据文件。 使用来获取指定生物的所有元数据。 要附加本地数据，您可以向tsv文件中添加新行，并填写以下各列：
Experiment ：对于公共数据，这是您的SRX ID。 对于本地数据，应使用标准化的ID命名数据（例如ecoli_0001）
LibraryLayout ：要么成对或非单
Platfo
2021-09-17 14:48:17
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NCBI blast 2.10.1 windows版The NCBI provides a suite of command-line tools to run BLAST called BLAST+. This allows users to perform BLAST searches on their own server without size, volume and database restrictions. BLAST+ can be used with a command line so it can be integrated directly into your work
2021-07-13 12:21:11
86.77MB
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在NCBI的SRA数据库上传序列文件时使用的上传工具客户端，配置浏览器上传插件使用。
2021-04-29 01:32:34
42.85MB
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