种群模型 哈萨克斯坦鼠疫耶尔森鼠疫菌的洞穴水平复合种群模型 setup.r 组织数据并在函数中运行以运行模型,即将数据从距离矩阵中加载的 5 个类转换为 occupied/empty 所有函数都在 metapopulation-functions.r 中,包括数据设置函数、估计参数的函数和运行模拟的函数 run-model.r 允许运行估计和模拟
2022-06-11 18:23:09 3.74MB R
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自然界中处于同一环境下两种群互相竞争同时存在的现象是很普遍的。两种群可以独立生存消耗同一种资源,则可建立模型 dx/dt=r_1 x(1-x/n_1 -s_1 y/n_2 ) dy/dt=r_2 y(1-s_2 x/n_1 -y/n_2 ) 其中x(t), y(t)分别为甲, 乙两种群的数量, 与 为固有增长率, 与 为最大容量。 表示乙种群单位数量所消耗资源相对于甲种群单位数量所消耗资源的倍数, 意义类似, 不过是甲相对于乙。令 , , , , ,对x(t), y(t)进行模拟, 研究其发展趋势。 进一步分别在下述情况下,研究该生态系统的发展趋势: ; ; . 具体参数可自行修改
2022-06-02 09:11:08 28KB 文档资料
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R中的种群遗传学和基因组学 Niklaus J.Grünwald,Zhian N. Kamvar,悉尼E. Everhart,Brian J. Knaus和Javier F. Tabima 欢迎! 该引物为在R中进行种群遗传数据的应用分析提供了简要的介绍,特别着重于非模型种群,包括克隆或部分克隆的生物。 它提供了宝贵的资源,可用于对不一定符合教科书遗传学且可能或可能不会处于Hardy-Weinberg平衡状态的人群进行精确的分析。 尽管此入门知识不需要R编程方面的广泛知识,但希望用户安装R和该入门知识所需的所有软件包。 我们最近对引物进行了实质性的修改,以包括种群基因组数据,即VCF数据,该数据是通过对完整或缩减代表性基因组的种群进行高通量测序而得出的。 请注意,本入门手册仍在编写中,并将在我们继续编写时对其进行更改。 请向我们提供有关您可能发现的任何错误或改进建议的反馈。 底漆目
2022-05-20 00:44:59 33.26MB HTML
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遗传算法matlab初始化代码Python 上的简单遗传算法 这个项目展示了python中的遗传算法过程 为什么是Python? 因为我喜欢它 讨厌Python? 这是你的问题:P 要求 pip install numpy 算法说明 遗传算法流程图 1.初始化人口 什么是人口? 人口是基因的集合 什么是基因? 它是人口中的一个个体 为了简单的解释,我有一个例子: gen = 'Hello World!' Population = ('Hello World!', 'Hello Wordd!', 'Hello Morth!') 那么如何创建或初始化人口? 只需创建随机生成并收集它,将其保存在一个变量中。 这是如何生成新的随机基因并将其收集到种群中的代码。 人口的数据类型是一个字典,matlab 只使用结构。 在将其保存到群体中之前,我们需要计算基因与目标之间的适应度。 如果 gen 与目标匹配,则适应度的值为 100。因此在种群中我们将生成一对 gen 及其适应度 # generate new gen def create_gen(panjang_target): random_numb
2022-05-15 21:24:51 3KB 系统开源
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数学建模是程序设计的重要的一部分,学好建模,才能更好的编程。
2022-05-07 17:05:49 1.06MB 数学建模
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本资源是数学建模中关于种群相互依存模型的论文。祝大家学习进步。
2022-05-07 16:54:04 258KB SHUXUEJIANMO
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matlab开发,实现车间调度问题,可以自己设置工件工序数据。 global mn nn ma ;%mn为总工件数,nn为总工序数,ma为机器数计数从1开始 global M T; %/M为以工件为行,工序为列的机器号矩阵,T为相应的时间矩阵 %global finish;%finish为O(ijk)能够完成的最早时间; global MAX INF;%MAX为数组的最大值,INF为规定的最大值
2022-05-06 13:04:58 23KB CCGA 多种群
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大数据-算法-集合种群时空动态对生态位构建的响应研究.pdf
2022-05-06 10:05:00 3.57MB 算法 big data 文档资料
bnpsd bnpsd (“ Balding-Nichols Pritchard-Stephens-Donnelly”)R包用于模拟混合种群。 更具体地说, bnpsd促进了混合种群结构的构建以及来自BN-PSD混合模型的等位基因频率和基因型的模拟。 该模型将针对中间亚群的Balding-Nichols(BN)等位基因频率模型与特定于特定混合物比例的Pritchard-Stephens-Donnelly(PSD)模型相结合。 该模型可以模拟复杂的人口结构,非常适合说明亲属系数和FST估计方面的挑战。 请注意,模拟的基因座是独立绘制的(处于连锁平衡状态)。 安装 该软件包的稳定版本现在位于CRAN上,可以使用以下命令安装 install.packages( " bnpsd " ) 可以使用devtools从GitHub存储库安装当前开发版本: install.packages( " d
2022-05-05 22:29:07 102KB R
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